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Enregistrement W4242713455 · doi:10.22215/etd/2021-14431

Metabolic Regulation of Antiviral Immune Responses in Macrophages

2021· dissertation· en· W4242713455 sur OpenAlexaff
Duale Ahmed

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmune systemBiologyCell biologyMacrophageTLR3InflammationMitochondrionMicrovesiclesImmunologymicroRNAInnate immune systemToll-like receptorBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is increasingly clear that there is an intimate link between cellular metabolism and macrophage function.Several studies in the last decade have established that alterations in cellular metabolism both drive and regulate macrophage function, allowing them to mount a functional immune response against viruses by promoting viral resistance, antigen presentation and the production of inflammatory and antiviral cytokines.As a result, metabolic reprogramming of macrophages allows them to adapt the spectrum and magnitude of their response depending on the microenvironment, stimuli, and stage of infection.Yet, it is unclear how different viral ligands alter metabolism to induce specific immune responses and if specific metabolic components can act as rheostats to amplify these responses based on the microenvironment.The central hypothesis of my thesis is that cellular metabolism is crucial to regulating antiviral immune responses.Specifically, I hypothesized that differential mitochondrial reprogramming allows macrophages to modulate ligand-specific effector response.Moreover, mitochondria further function as rheostats, fine-tuning immune responses based on the microenvironment.First, I used publicly available microarray datasets to develop a metabolic signature associated with early IFN-α responses in mouse BMMs and human MDMs.>500 metabolic genes related to cellular bioenergetics, cellular redox status, amino acid, and lipid metabolism were identified.Next, I show that TLR3 and TLR4 engagement in mouse BMMs drive differential ETC remodeling, linked to differential mitochondrial activity and subsequent ROS generation, to support ligand-specific inflammatory and antiviral profiles.Furthermore, when exploring different types of TLR3 engagement, based on ligand length, they trigger distinct inflammatory and antiviral iii programs, due to unique regulatory mechanisms surrounding HIF-1α function as well as altered ETC architecture and function, respectively.The aim of this thesis is to gain a more thorough understanding of the critical role of cellular metabolism in regulating macrophage antiviral responses.A systematic understanding of these critical processes to regulating effector function under non-diseased conditions can provide critical insights into the dysregulation of metabolic processes during chronic viral infections.The data presented may be the foundation towards the development of new antiviral therapeutics by targeting selective mitochondrial components.iv DEDICATION To HODAN NALAYEH Your legacy lives on through us!To all the dream chasers in the world, keep chasing!This is an important discussion and I'm glad we're having it!v

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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