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Enregistrement W4243127004 · doi:10.21203/rs.2.22049/v1

Daily variations of gut microbial translocation markers in ART-treated HIV-infected people

2020· preprint· en· W4243127004 sur OpenAlexfundno aff
Jing Ouyang, Stéphane Isnard, John C. Lin, Brandon Fombuena, Debashree Chatterjee, Tomas Raul Wiche Salinas, Delphine Planas, Amélie Cattin, Augustine Fert, Etiene Moreira Gabriel, Laurence Raymond Marchand, Yonglong Zhang, Malcolm Finkelman, Yaokai Chen, Daniel E. Kaufmann, Nicolas Cermakian, Petronela Ancuța, Jean‐Pierre Routy

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV-related health complications and treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversité de MontréalMcGill UniversityFondation du CHUM
Mots-clésChromosomal translocationHuman immunodeficiency virus (HIV)Intestinal permeabilityLipopolysaccharideBacterial translocationPhysiologyMedicineMorningBiologyImmunologyInternal medicineBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Gut microbial translocation and increased intestinal barrier permeability are significant contributors to inflammatory non-AIDS co-morbidities in people living with HIV (PLWH). However, daily variations of markers of bacterial and fungal translocation along with intestinal damage are not characterized yet. Herein, we assessed the variation of these markers over 24 hours in PLWH receiving antiretroviral therapy (ART) in a well-controlled environment. Methods A total of 11 male ART-treated PLWH were recruited for the study. Blood samples were collected every 4 hours over 24 hours before snacks/meals from 8:00 in the morning to 8:00 the next day. All participants consumed similar meals at set times, and had a comparable amount of sleep, physical exercise and light exposure. Plasma levels of bacterial lipopolysaccharide (LPS) and fungal (1→3)-β-D-Glucan (BDG) translocation markers, along with markers of intestinal damage fatty acid binding protein (I-FABP) and regenerating islet-derived protein-3α (REG3α) were assessed by ELISA or the fungitell assay. Results Plasma levels of BDG and REG3α were stable during the day. In contrast, plasma levels of LPS and I-FABP were subject to daily variations, with the lowest levels at 12:00 and 16:00, respectively, and the highest levels at 00:00 and 4:00-8:00, respectively. Conclusions Conversely to the fungal translocation marker BDG and the gut damage marker REG3α, time of blood collection matters for the proper evaluation for LPS and I-FABP as markers for the risk of inflammatory non-AIDS co-morbidities. These insights are instrumental for orienting clinical investigations in PLWH.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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