Thioesterase from Cereulide Biosynthesis Is Responsible for Oligomerization and Macrocyclization of a Linear Tetradepsipeptide
Notice bibliographique
Résumé
Cereulide is a cyclic depsidodecapeptide produced in Bacillus cereus by two non-ribosomal peptide synthetases, CesA and CesB. While highly similar in structure and with a homologous biosynthetic gene cluster to valinomycin, recent work suggests that cereulide is produced via a different mechanism, which relys on a non-canonical coupling of two didepsipeptide-PCP bound intermediates. Ultimately this alternative mechanism generates a tetradepsipeptide-PCP bound intermediate that is prosed to differ from the tetradepsipeptide predicted from canonical activity of CesA and CesB. To test this hypothesis, we chemically synthetize both tetradepsipeptides as N-acetyl cysteamine thioesters and probed the ability of the purified recombinant terminal CesB thioesterase (CesB TE) to oligomerize and macrocyclize each substrate. Only the canonical substrate is converted cereulide, ruling out this alternative mechanism. We also show that CesB TE can use related tertradepsipeptide substrates, such as the valinomycin tetradespipetide and a hybride cereulide-valinomycin tetradespispetide in conjunction with its native substrate to generate chimeric natural products. This work clarifies the biosynthetic origins of cereulide and provides a powerful biocatalyst to access analogs of these ionophoric forming natural products.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».