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Enregistrement W4243756908 · doi:10.26434/chemrxiv.12616178

A Chemical Probe for Dark Kinase STK17B Derives its Potency and High Selectivity Through a Unique P-loop Conformation

2020· preprint· en· W4243756908 sur OpenAlexafffund
Alfredo Picado, A. Chaikuad, Carrow I. Wells, Safal Shrestha, William J. Zuercher, Julie E. Pickett, Frank E. Kwarcinski, Parvathi Sinha, Chandi de Silva, Reena Zutshi, Shubin Liu, Natarajan Kannan, Stefan Knapp, David H. Drewry, Timothy M. Willson

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer therapeutics and mechanisms
Établissements canadiensStructural Genomics Consortium
Organismes subventionnairesDeutsches Elektronen-SynchrotronDeutschen Konsortium für Translationale KrebsforschungNovartis PharmaNational Institutes of HealthMinistero dello Sviluppo EconomicoUniversidade Estadual de CampinasMerck KGaAOntario Ministry of Economic Development and InnovationGenome CanadaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloLineberger Comprehensive Cancer Center, University of North Carolina at Chapel HillDiamond Light SourcePfizer
Mots-clésChemistryKinaseSelectivityStereochemistrySalt bridgePyrimidineBiochemistryGeneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We present the discovery of thieno[3,2-<i>d</i>]pyrimidine <b>SGC-STK17B-1</b> (<b>11s</b>), a high-quality chemical probe for this understudied “dark” kinase. <b>11s</b> is an ATP-competitive inhibitor that showed remarkable selectivity over other kinases including the closely related STK17A. X-ray crystallography of <b>11s</b> and related thieno[3,2-<i>d</i>]pyrimidines bound to STK17B revealed a unique P-loop conformation characterized by a salt bridge between R41 and the carboxylic acid of the inhibitor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,222
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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