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Enregistrement W4244015505 · doi:10.1139/w01-105

Salicylate inhibits the translation and transcription of<i>ompF</i>in<i>Escherichia coli</i>

2001· article· en· W4244015505 sur OpenAlexvenueno aff
Nat Ramani, Kwaku Boakye

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésOsmotic concentrationTranscription (linguistics)Messenger RNAEscherichia coliSodium salicylateBiologyMolecular biologyPorinBacterial outer membraneBiochemistryChemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OmpF is a major outer membrane protein in Escherichia coli whose expression is regulated by a large number of factors, including the osmolarity of the growth medium and the concentration of salicylate. We have previously shown that at low osmolarity, OmpF is post-transcriptionally regulated by micF mRNA, and that at high osmolarity, regulation occurs primarily by the inhibition of transcription by OmpR (Ramani et al. 1994). In contrast, salicylate was reported to alter OmpF expression solely by blocking translation primarily through micF mRNA (Rosner et al. 1991). We examined the effect of salicylate by analyzing the levels of OmpF in wild-type and micF–strains grown with salicylate. At low concentrations of salicylate (0–4 mM), OmpF levels were inhibited strongly in wild-type cells, whereas no inhibition of OmpF was observed in the micF–strain. At high concentrations of salicylate (10–20 mM), both the wild type and the micF–strain showed strong inhibition of OmpF. To study the effect of salicylate on transcription, ompF mRNA and micF mRNA were analyzed in wild-type cells. micF mRNA levels increased during growth with 1, 2, and 4 mM salicylate. In contrast, ompF mRNA levels were not affected by low concentrations of salicylate, but decreased strongly at 10 and 20 mM salicylate. Taken together, these results suggest that similar to osmoregulation, salicylate inhibits both the translation and transcription of ompF.Key words: salicylate, OmpF, micF, osmoregulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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