<i> <scp>H</scp> alarsenatibacter </i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Hal.ar.se.na.ti.bac ' ter. Gr. n. hals, halos, salt, N.L. n. arsenas, ‐atis , arsenate, N.L. masc. n. bacter , rod; N.L. masc. n. Halarsenatibacter , the salty, arsenate‐respiring rod. The genus Halarsenatibacter is classified into the family Halanaerobiaceae , order Halanaerobiales, and in the class Clostridia . Currently, a single species, H. silvermanii , has been described. This haloalkaliphilic, motile bacterium stains Gram‐negative and is shaped as a slightly curved rod. H. silvermanii is an obligate anaerobe that uses arsenate, Fe(III), or elemental sulfur as electron acceptors for chemoheterotrophic growth with electron donors such as lactate, pyruvate, malate, and sugars such as galactose, sucrose, and fructose. Fermentative growth was not observed. Chemoautotrophic growth occurs with sulfide as the electron donor and arsenate as the electron acceptor, but cells lack RubisCO activity as the means for CO 2 fixation. The major membrane fatty acids included saturated branched (46%), unsaturated branched (10%), normal saturated (32.5%), and normal unsaturated (11.2%) fatty acids as detailed in Switzer Blum et al. (2009a). DNA G + C content ( mol% ): 42.5 as analyzed by HPLC by the DSM. Type species : Halarsenatibacter silvermanii Switzer Blum, Han, Lanoil, Saltikov, Witte, Tabita et al., 2009b, 1985 VP (Effective publication: Switzer Blum, Han, Lanoil, Saltikov, Witte, Tabita et al., 2009a, 1959). Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Halarsenatibacter is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Bacillati / Bacillota / Clostridia / Halanaerobiales / Halanaerobiaceae / Halarsenatibacter The genus Halarsenatibacter can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Halarsenatibacter (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Bacillota_F / c__Halanaerobiia / o__Halanaerobiales / f__Halarsenatibacteraceae / g__Halarsenatibacter * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 ** Parks et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D785 – D794 ; DOI: 10.1093/nar/gkab776
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,106 | 0,050 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».