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Enregistrement W4244117175 · doi:10.1002/9781118960608.gbm01726

<i> <scp>H</scp> alarsenatibacter </i>

2019· other· en· W4244117175 sur OpenAlexaff
Ronald S. Oremland, Jodi Switzer Blum, John F. Stolz, Chad Saltikov, Brian Lanoil

Notice bibliographique

RevueBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria · 2019
Typeother
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClostridiaFirmicutesChemistryArsenateBiochemistryObligate anaerobeStereochemistryBacteriaBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Hal.ar.se.na.ti.bac ' ter. Gr. n. hals, halos, salt, N.L. n. arsenas, ‐atis , arsenate, N.L. masc. n. bacter , rod; N.L. masc. n. Halarsenatibacter , the salty, arsenate‐respiring rod. The genus Halarsenatibacter is classified into the family Halanaerobiaceae , order Halanaerobiales, and in the class Clostridia . Currently, a single species, H. silvermanii , has been described. This haloalkaliphilic, motile bacterium stains Gram‐negative and is shaped as a slightly curved rod. H. silvermanii is an obligate anaerobe that uses arsenate, Fe(III), or elemental sulfur as electron acceptors for chemoheterotrophic growth with electron donors such as lactate, pyruvate, malate, and sugars such as galactose, sucrose, and fructose. Fermentative growth was not observed. Chemoautotrophic growth occurs with sulfide as the electron donor and arsenate as the electron acceptor, but cells lack RubisCO activity as the means for CO 2 fixation. The major membrane fatty acids included saturated branched (46%), unsaturated branched (10%), normal saturated (32.5%), and normal unsaturated (11.2%) fatty acids as detailed in Switzer Blum et al. (2009a). DNA G + C content ( mol% ): 42.5 as analyzed by HPLC by the DSM. Type species : Halarsenatibacter silvermanii Switzer Blum, Han, Lanoil, Saltikov, Witte, Tabita et al., 2009b, 1985 VP (Effective publication: Switzer Blum, Han, Lanoil, Saltikov, Witte, Tabita et al., 2009a, 1959). Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Halarsenatibacter is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Bacillati / Bacillota / Clostridia / Halanaerobiales / Halanaerobiaceae / Halarsenatibacter The genus Halarsenatibacter can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Halarsenatibacter (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Bacillota_F / c__Halanaerobiia / o__Halanaerobiales / f__Halarsenatibacteraceae / g__Halarsenatibacter * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 ** Parks et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D785 – D794 ; DOI: 10.1093/nar/gkab776

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,175
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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