Positive and negative predictive values from published studies can be misleading for decision-making in clinical practice: reply
Notice bibliographique
Résumé
1Department of Internal Medicine, Innsbruck Medical University, Innsbruck and 2General Hospital of the Elizabethenians, Klagenfurt, Austria Sir, The letter to the editor by Rudwaleit and Sieper points out the important role of the likelihood ratio (LR) as a description of the diagnostic value of any diagnostic test in comparison to the restricted usefulness of positive and negative predictive values. The authors demonstrate in various examples the dependence of the positive and negative predictive values on the prevalence of the disease within the population tested. We totally agree with the conclusion of Rudwaleit and Sieper that highlighting the positive predictive value of specific antibodies cross-reacting with a 28 kDa Drosophila antigen in ankylosing spondylitis (AS) patients [1] may be misleading for clinical decision-making. We also share the opinion that testing patients suspicious for AS for the presence of antibodies cross-reacting with the 28 kDa Drosophila antigen may have an additional diagnostic value. The positive LRs, provided in Table 2, were calculated to be 1.9, 2.2 and 3.8 for the cut-off levels of ≥50, ≥60 and ≥75 U/ml, respectively. Choosing a higher cut-off of ≥125 U/ml results in a further increase in the positive LR (7.3, Du et al., unpublished) but decreases the sensitivity of this test below 20%. Then the question arises whether such a gain in the positive LR, paralleled with poor sensitivity, is helpful in clinical practice. Using a cut-off of ≥75 U/ml, the positive LR of 3.8 is comparable with the diagnostic value of inflammatory back pain, enthesitis of the heel or peripheral arthritis [2], with a sensitivity of 30.7%. [1] As serological signs of inflammation measured by the ESR and CRP levels are often absent in AS patients [3] and diagnosis of AS in HLA-B27 negative patients is unacceptably delayed, [4] a positive enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) test result can contribute to the diagnostic evaluation of these patients, expanding the diagnostic laboratory assessments available so far. Notably, in this study the presence of antibodies cross-reacting with the 28 kDa Drosophila antigen was independent of the HLA-B27 status in AS patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,017 | 0,115 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,005 |
| Communication savante | 0,003 | 0,008 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,033 | 0,039 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».