Influence of N‐terminal residue stereochemistry on the prolyl amide geometry and the conformation of 5‐tert‐butylproline type VI β‐turn mimics
Notice bibliographique
Résumé
The effects of N-terminal amino acid stereochemistry on prolyl amide geometry and peptide turn conformation were investigated by coupling both 𝓁- and 𝒹-amino acids to (2S, 5R)-5-tert-butylproline and 𝓁-proline to generate, respectively, N-(acetyl)dipeptide N′-methylamides 1 and 2. Prolyl amide cis- and trans-isomers were, respectively, favored for peptides 1 and 2 as observed by proton NMR spectroscopy in water, DMSO and chloroform. The influence of solvent composition on amide proton chemical shift indicated an intramolecular hydrogen bond between the N′-methylamide proton and the acetamide carbonyl for the major conformer of dipeptides (S)-1, that became less favorable in (R)-1 and 2. The coupling constant (3JNH,α) values for the cis-isomer of (R)-1 indicated a ϕ2 dihedral angle value characteristic of a type VIb β-turn conformation in solution. X-ray crystallographic analysis of N-acetyl-𝒹-leucyl-5-tert-butylproline N′-methylamide (R)-1b showed the prolyl residue in a type VIb β-turn geometry possessing an amide cis-isomer and ψ3-dihedral angle having a value of 157°, which precluded an intramolecular hydrogen bond. Intermolecular hydrogen bonding between the leucyl residues of two turn structures within the unit cell positioned the N-terminal residue in a geometry where their ϕ2 and ψ2 dihedral angle values were not characteristic of an ideal type VIb turn. The circular dichroism spectra of tert-butylprolyl peptides (S)- and (R)-1b were found not to be influenced by changes in solvent composition from water to acetonitrile. The type B spectrum exhibited by (S)-1b has been previously assigned to a type VIa β-turn conformation [Halab L, Lubell WD. J. Org. Chem. 1999; 64: 3312–3321]. The type C spectrum exhibited by the (R)-1b has previously been associated with type II′ β-turn and α-helical conformations in solution and appears now to be also characteristic for a type VIb geometry. Copyright © 2001 European Peptide Society and John Wiley & Sons, Ltd.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
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