Theoretical studies on the pK~a~ values of perfluoroalkyl carboxylic acids: Non-helical conformation acidity constants for n-perfluorooctanoic acid (n-PFOA)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract A molecular mechanics force field method (MMFF94) systematic rotor conformational search was conducted on the well known environmental contaminant n-perfluorooctanoic acid (n-PFOA). The MMFF94 conformational search yielded 2915 separate low- through high-energy conformers of n-PFOA. Ranking of these structures gave the 94 lowest MMFF94 energy conformations that were subjected to subsequent density functional theory (DFT) computational investigations at the B3LYP/6-311++G(d,p) level of theory. Application of a thermodynamic cycle approach, coupled with aqueous and gas phase DFT calculations on the molecular and anionic forms for each of the 94 lowest energy n-PFOA conformers, gave estimated acidity constants (pK~a~ values) for a final converged set of twelve n-PFOA conformers, including the global minimum helical perfluoroalkyl chain geometry and eleven non-helical higher energy conformations. Collectively, the twelve lowest energy conformers appear to completely encompass the global conformational space for n-PFOA, indicating no higher energy conformations likely remain that could appreciably influence the observed composite aqueous pK~a~ of this compound. The estimated pK~a~ values of all eleven non-helical n-PFOA conformers were within 0.1 pK~a~ units of the helical conformer pK~a~. The findings support previous predictions and recent experimental evidence for an aqueous phase n-PFOA monomeric pK~a~ of about zero.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».