Microsatellite and mitochondrial DNA analysis of Dungeness crab (Cancer magister) from California to northern British Columbia
Notice bibliographique
Résumé
Genetic variation was assessed using mitochondrial DNA and microsatellite markers from Dungeness crab between Iceberg Bay, British Columbia and San Luis Obispo, California. We found little pattern in overall genetic variation between sites in both marker types, and no significant Isolation by Distance model was fit. Site-specific variation in mitochondrial DNA haplotype frequencies suggested the existence of three subpopulations associated with the Alaska Current, the Puget Sound, and the California Current, but microsatellite DNA evidence did not support it. The ratio between sampling size for microsatellite markers and fragment size polymorphisms was low, limiting the resolving power of microsatellite DNA for neutral variation. Average pairwise Fst values for Iceberg Bay, British Columbia against all other populations was 0.156, as compared to the average pairwise Fst of 0.028 across all populations. In the southern region of the Puget Sound, Nisqually, Washington had a lower pairwise Fst of 0.044 but contained a large number of site-specific, unique mtDNA haplotypes. Additionally, we found 41 mtDNA haplotypes in 445 samples taken, with 23 of those haplotypes as "singletons," suggesting that Dungeness crab went through a recent, post-bottleneck population expansion, likely associated with the most recent glacial relaxation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».