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Enregistrement W4244747610 · doi:10.21203/rs.3.rs-39873/v1

SMPD3-mediated extracellular vesicle biogenesis inhibits oligodendroglioma growth

2020· preprint· en· W4244747610 sur OpenAlexafffund
Anjali Balakrishnan, Lata Adnani, Vorapin Chinchalongporn, Lakshmy Vasan, Oleksandr Prokopchuk, Myra J. Chen, Ahmed El‐Sehemy, Thomas Olender, Yacine Touahri, Shiekh Tanveer Ahmad, Rehnuma Islam, Sajeevan Sujanthan, Dawn Zinyk, Lacrimioara Comanita, Boris Kan, Taylor Fleming, Hon S. Leong, Cindi M. Morshead, Marjorie Brand, Valerie A. Wallace, Jennifer A. Chan, Carol Schuurmans

Notice bibliographique

RevueResearch Square (Research Square) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensSunnybrook Health Science CentreOttawa HospitalKrembil FoundationUniversity of CalgaryMcGill UniversityAlberta Children's HospitalSunnybrook HospitalUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanada First Research Excellence FundInternational Development Research CentreCancer Research Society
Mots-clésOligodendrogliomaExtracellularCell biologyBiologyCancer researchIntracellularBiogenesisCell cultureCell growthGliomaBiochemistryGeneAstrocytomaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Oligodendrogliomas are lower-grade, slow-growing gliomas that are ultimately fatal. Although driver mutations are known, the mechanisms underlying their signature slow growth rates are poorly understood. We found evidence for intra-tumoral interactions between neoplastic and non-neoplastic cells in oligodendroglioma tissues. To further study these cell interactions, we used two patient-derived oligodendroglioma cell lines of lower and higher aggressivity. Both oligodendroglioma cell lines released extracellular vesicles that had cytotoxic effects on non-neoplastic and neoplastic cells, but each had distinct vesicular proteomes. Consistent with extracellular vesicles mediating growth inhibitory effects in oligodendrogliomas, higher expression levels of several extracellular vesicle biogenesis genes (SMPD3, TSG101, STAM1) correlates with longer survival in oligodendroglioma patients. Furthermore, SMPD3 overexpression slows oligodendroglioma cell growth in culture. Conversely, SMPD3 knockdown enhances oligodendroglioma proliferation in vitro, in murine xenografts, and in human cerebral organoid co-cultures. Oligodendroglioma-derived extracellular vesicles thus mediate tumor cell microenvironmental interactions that contribute to low aggressivity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Science ouverte, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0050,012
Intégrité de la recherche0,0020,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,385
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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