TSPY Gene Copy Number and Levels of mRNA for TSPY and Cell Cycle, Meiosis and Early Male Germ Cell Marker Genes in Holstein Bulls.
Notice bibliographique
Résumé
Testis-specific protein, Y-encoded (TSPY) is present in varying gene copy number in both human and cattle. Copy number variation of TSPY has been linked to spermatogenesis and is hypothesized to be a potential indicator of male fertility although there is limited data on TSPY expression in testicular tissue. Mice have only a single, non-functional TSPY gene whereas cattle have multiple functional copies and since slaughterhouse testicular material is readily available, cattle are a better model species for TSPY analyses. This study aims to compare TSPY copy number and mRNA transcript levels with that of various genes related to cell cycle and meiosis in Holstein bulls. To do this we measured TSPY copy number in DNA extracted from blood (n=51) and TSPY expression in total mRNA extracted from testicular tissue (n=26) with real time polymerase chain reaction (PCR). Our results show that TSPY copy number is negatively correlated to TSPY mRNA expression in the testis (r=-0.694, p<0.0001). We also found negative correlations of TSPY copy number and positive correlations of TSPY mRNA expression with various cell cycle genes (CCNB1, CCNB2, CDK1), meiotic genes (RAD51, SYCP3 and MLH1) and markers of early germ cells (UCHL1, TRPC2). Based on our results, it appears that TSPY expression may represent a good marker of early male germ cells. The negative correlation that we found between TSPY copy number and TSPY expression may have useful applications; TSPY copy number could be measured in blood to predict the amount of early germ cells in individual bulls. Supported by National Sciences Engineering and Research Council grant 364747-08; Canadian Research Chair program; and L'Alliance Boviteq Inc. (poster)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».