Structural Profiles of p53 Gene Mutations Predict Clinical Outcome in Diffuse Large B-Cell Lymphoma: An International Collaborative Study.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Mutations of the p53 tumor suppressor gene have been associated with a poor clinical outcome in some series of diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL). However, conflicting results have been reported in other studies. The purpose of this study was to analyze the p53 mutations in DLBCL from twelve centers, and to correlate the structural profiles of the mutations with clinical outcome. The p53 mutations were identified in 102 of 477 cases of DLBCL for a frequency of 21.4%. These included 92 missense mutations, 5 nonsense mutations, 4 deletions, and 1 insertion. The presence of any p53 mutation correlated with poor overall survival (OS; P=0.002). Sixty-two of 102 cases (61%) had mutations in the DNA binding domains of the p53 gene, and the mutations in the DNA-binding domains were found to be the most important predictor of poor OS (P<0.001). In contrast, mutations in the non-DNA binding domains did not correlate with OS (P=0.158). The 5-year survival rate was 24% in patients with any p53 mutation (median survival=1.33 yr) and 19% of patients with the DNA-binding domain mutations (median survival=1.0 yr) compared to 41% for those with wild type p53 (wt-p53, median survival=4.5 yr). The complete remission rate was 57% in patients with any p53 mutation and 54% in patients with the DNA-binding domain mutations compared to 69% for those with wt-p53. Of the mutations in the DNA-binding domains, patients with mutations in the loop-sheet-helix motifs (Loop L1-S10-H2, 20% of all mutations) and DNA minor binding groove motif (Loop L3, 22% of all mutations) had significantly decreased OS (P=0.002). In contrast, OS was not significantly decreased for patients with mutations in Loop L2 (18% of all mutations). Multivariate analysis confirmed that the International Prognostic Index, age, tumor size, serum lactate dehydrogenase, and mutations in the DNA binding motifs were independent predictors of OS. The p53 mutation profile was also found to stratify germinal center B-cell-like DLBCL, but not activated B-cell-like DLBCL, into molecularly distinct subsets with different clinical outcomes. This study demonstrates the importance of the mutational profile in the DNA binding domains of the p53 gene for predicting clinical outcome and refining current prognostic models including gene expression profiling in patients with DLBCL.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».