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Enregistrement W4245871487 · doi:10.1002/9780470015902.a0005040.pub2

Alternative Processing: Neuronal Nitric Oxide Synthase

2011· other· en· W4245871487 sur OpenAlexaff
Philip A. Marsden, Derek C. Newton, Albert K.Y. Tsui

Notice bibliographique

RevueEncyclopedia of Life Sciences · 2011
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExonUntranslated regionBiologyPromoterGeneMessenger RNAGeneticsFive prime untranslated regionStart codonTranscription (linguistics)Gene expressionMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The human neuronal nitric oxide synthase (nNOS) gene is expressed from multiple promoters and is subject to alternate messenger ribonucleic acid (mRNA) processing. These complex molecular mechanisms contribute to regulating gene expression and function in multiple tissues and cell types. In the case of nNOS, these distinct promoters give rise to mRNA transcripts with untranslated leader sequences that have differing lengths, nucleotide composition and three‐dimensional structure. These distinct leader sequences have robust effects on translational efficiency. In disease settings, these have functional relevance. For example, in settings of low oxygen content, a unique promoter becomes trancriptionally active. In contrast to basally expressed transcripts, this hypoxia‐induced mRNA is very efficiently translated. To accommodate diverse biological roles, multiple mechanisms have evolved to produce a diverse range of nNOS mRNA transcripts from a single genetic locus. Key Concepts: Mammalian genes can have more than one promoter. Having more than one promoter implies that the gene has more than one version of exon 1. Initiation of transcription in different regions of genomic DNA imparts different nucleotide sequences to the leader regions of messenger ribonucleic acid transcripts, also known as the 5′‐untranslated region (5′‐UTR). Different leader sequences may, or may not, affect protein structure depending on whether the initiator AUG codon for translation of the protein lies in exon 1 or downstream. If multiple versions of exon 1 all have their own initiator AUG codon, then the encoded protein will exist if different forms, each with a uniqueN‐terminal peptide sequence. Different 5′‐UTRs of messenger ribonucleic acid transcripts can have functional effects on expression of the encoded protein. The 5′‐UTRs of messenger ribonucleic acid transcripts can affect translational efficiency. The 5′‐UTRs of messenger ribonucleic acid transcripts can affect subcellular messenger ribonucleic acid transcript localisation. The 5′‐UTRs of messenger ribonucleic acid transcripts can affect messenger ribonucleic acid transcript stability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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