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Enregistrement W4245960564 · doi:10.12688/aasopenres.12844.1

Model framework for governance of genomic research and biobanking in Africa – a content description

2018· preprint· en· W4245960564 sur OpenAlexfundno aff
Aminu Yakubu, Paulina Tindana, Alice Matimba, Katherine Littler, Nchangwi Syntia Munung, Ebony Madden, Ciara Staunton, Jantina de Vries

Notice bibliographique

RevueAAS Open Research · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteNational Institutes of HealthUniversity of OxfordAfrican Academy of SciencesBroad InstituteWellcome TrustMcGill UniversityWellcome
Mots-clésBiobankCorporate governanceConfidentialityGenomicsEquity (law)Translational researchPolitical scienceBusinessPublic relationsBiologyBiotechnologyGenomeBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genomic research and biobanking are expanding globally, with a promise to fast-track the research needed to improve approaches to disease treatment and prevention through scientific collaborations such as the Human Heredity and Health in Africa (H3Africa) initiative. Integral to this type of research is the availability of samples and data for research. The need for broad access brings along a host of ethical concerns, including those related to privacy and confidentiality, as well as fairness and equity in access and capacity to utilise these samples between scientists from the high income and low income countries. Addressing these concerns while promoting genomic research, especially in Africa, requires the implementation of a sound governance framework. In this paper, we describe the contents of a Framework for Best Practice for Genomics Research and biobanking in Africa that was developed, under the auspices of the H3Africa initiative. This framework is broad enough to be used and adapted by African countries to facilitate the development of country-specific guidelines and to help improve the conduct and governance of genomics research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaIntégrité de la recherche
Domaine: non disponible · Genre: Méthodes
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Théorique ou conceptuellow
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Autre
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Théorique ou conceptuellow
modèles en désaccordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,025
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,131

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0250,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0050,011
Communication savante0,0130,011
Science ouverte0,0030,006
Intégrité de la recherche0,0070,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,945
Tête enseignante GPT0,682
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Intégrité de la recherche

Les modèles divergent sur des parties de cette classification; chaque voix est préservée dans la section en fin de page.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes · Autre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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