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Enregistrement W4246113716 · doi:10.24908/iqurcp.9186

Cleavage of Arpin by Calpain as a Potential Regulation Mechanism of the Arp2/3 Complex and Cell Motility

2018· article· en· W4246113716 sur OpenAlexvenueno aff
Renee Potashner

Notice bibliographique

RevueInquiry Queen s Undergraduate Research Conference Proceedings · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCalpain Protease Function and Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalpainCell biologyMotilityProteasesActinBiologyCysteine proteaseBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell movement is mediated by cycles of actin polymerisation. A novel protein, Arpin, was discovered that has been suggested to decrease cell motility through competitive inhibition of WASP family proteins, the activators of the complex driving actin polymerisation. In preliminary studies, Arpin was found to inhibit the Arp2/3 complex (Gautreau and Blanchoin, personal communication). Arpin contains sequence homology to the Arp2/3-binding site of WASP proteins. Calpains, a family of intracellular calcium-dependent cysteine proteases, can be found near the plasma membrane and the concentration of calcium ion required for activation is decreased when calpain is bound to the plasma membrane in the presence of phospholipids (Leloup et al. 2010). The common localization of calpain and Arpin, along with the known contributions calpain has in regulating other cell motility proteins, makes calpain a likely candidate for Arpin regulation. By transfecting calpain wild-type (pz/pz), knockdown (p/p) and lentivirus rescue mouse embryonic fibroblasts with a plasmid containing the Arpin gene (c15orf38), I hope to show the presence of differential cleavage of Arpin by calpain in the wild-type cells compared to the calpain knock-down cells through Western blot analysis. Understanding how Arpin is regulated will provide a basis for further research in cell motility, which has contributions to cancer metastasis and other diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,484

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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