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Enregistrement W4246283852 · doi:10.1002/bip.20320

Abstracts of keynote & plenary lectures

2005· article· en· W4246283852 sur OpenAlexaff
Damien Boeglin, Raquel Simó Meléndez, Fabrice Galaud, R. Kaul, Simon Surprenant, Mandar S. Bodas, William D. Lubell, Scott J. Miller, Phillip Dawson

Notice bibliographique

RevueBiopolymers · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChemical Synthesis and Analysis
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCitationLibrary scienceComputer scienceInformation retrievalChemistryWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Identification of the secondary structure responsible for peptide biology is of academic interest to characterize natural modes of action, as well as industrially relevant for the development of peptide mimics.Traditionally, such scanning of peptide structure has been performed by systematic replacement of each residue in the peptide sequence with another proteinogenic amino acid.For example, alanine, enantiomeric amino acid and proline scans have been respectively performed to study the importance of side chains, stereochemistry and conformation on the biological activity of the peptide.Our lab has been developing alternative scanning methods for characterizing the relationship between peptide structure and activity.For example, we have recently introduced effective solid-phase methods for introducing aza-amino acid residues systematically at different positions along the peptide chain.Because aza-amino acid residues have been shown to adopt the i ϩ 1 and i ϩ 2 positions of beta-turns, aza-amino acid scanning offers potential for identifying regions of turn secondary structure which are important for biology.Similarly, we are pursuing solid-phase chemistry for introducing lactam constraints at different positions along the peptide.Our presentation will focus on recent achievements in the development of new methodology for scanning various peptide sequences to identify secondary structures relevant for biological activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,378
Score d'incertitude au seuil0,888

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,3780,288

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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