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Enregistrement W4246493101 · doi:10.1093/ibd/izy019.134

P122 THE ROLE OF PTPN2 SNP IN THE PATHOGENESIS OF FIBROSIS IN CROHN’S DISEASE

2018· article· en· W4246493101 sur OpenAlexaboutno aff
Chao Li, John F. Kuemmerle

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueGalectins and Cancer Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphorylationSTAT3Crohn's diseasePathogenesisCancer researchTyrosine phosphorylationFibrosisProtein tyrosine phosphataseMedicineBiologyImmunologyInternal medicineCell biologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We identified altered IL-6-induced Jak1-dependent STAT3 phosphorylation in human ileal subepithelial myofibroblasts (SEMF) of patients with stricturing Crohn’s disease. This resulted in co-localization of pSTAT3(Y705) to Rab5+ signaling endosomes along with pIGF-I receptors that jointly mediated excess collagen I production and proliferation in SEMF of strictures. PTPN2 gene variants occur in patients with Crohn’s disease with rs7234029 associated with apparent ‘loss-of-function’ and with stricturing disease. In other cells PTPN2 targets Jak and STAT3. Determine whether expression of rs7234029 in stricturing disease is associated with altered phosphatase activity, increase STAT3 phosphorylation, and excess collagen and proliferation in SEMF. Primary cultures of SEMF isolated from ileum of patients with Montreal B2 Crohn’s disease were naïve, transfected with wtPTPN2, or were used for CRISPR/Cas9-mediated PTPN2 gene deletion. Rs7234029 haplotype was determined in each subject. Increased basal pSTAT3, pErk1/2, collagen I production and proliferation in SEMF of strictured ileum were normalized by inhibition of STAT3 phosphorylation or expression of dominant negative STAT3(Y705F). Despite a 3-fold increase in PTPN2 protein in strictured SEMF in these cells, levels of STAT3 phosphorylation were also increased suggesting a loss-of-phosphatase function had occurred. Phosphatase function was restored by expression of wtPTPN2 and resulted in lowered levels of pSTAT3(Y705). This notion regarding PTPN2 was also confirmed in normal SEMF where CRISP/Cas9 mediated PTPN2 gene deletion resulted in a 4-fold increase in pSTAT3(Y705) levels. A loss of PTPN2 function associated with rs7234029 in SEMF of patients with stricturing Crohn’s disease leads to increased phosphorylation of pSTAT3(Y705), and results in the excess collagen I production and proliferation that occur in these patients’ strictures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,360

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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