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Enregistrement W4246534759 · doi:10.32920/ryerson.14664438

The characterization of MCEF : an AFF transcription factor associated with Acute Lymphoblastic Leukemia and HIV-1

2021· preprint· en· W4246534759 sur OpenAlexafffund
Zainab Al Shawaf

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMcMaster UniversityToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesUniversity of Ottawa
Mots-clésTranscription factorBiologyGene isoformPsychological repressionGeneChromosomal translocationVirologyTranscription (linguistics)Cancer researchLymphoblastic LeukemiaGeneticsLeukemiaGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL) results from environmentally-triggered in utero translocations between the Mixed Lineage Leukemia (MLL) gene and partner genes. In the most frequent cases of ALL, this partner gene is one of the AF4 family (AFF) of transcription factors. The newest AFF member to be discovered and cloned is AFF-4/AF5q31/MCEF. MCEF interacts with a transcription factor necessary for transcription of HIV-1. In addition, evidence suggests that male knockout mice are azoospermic. Therefore, the characterization of MCEF is clinically and theoretically important. The purpose of my research was to further characterize MCEF. In this paper, I first review the AFF members, focusing on MCEF. I then show a series of experimental results addressing MCEF isoforms and HIV-1 repression domains, as well as the generation of anti-MCEF antisera. Finally, I highlight intriguing results with live virus replication assays that suggest how MCEF could be exploited as a therapeutic target for AIDS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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