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Enregistrement W4246551654 · doi:10.3410/f.1024820.298849

Faculty Opinions recommendation of Basic mechanism of three-dimensional collagen fibre transport by fibroblasts.

2005· dataset· en· W4246551654 sur OpenAlexaff
Leah Keshet

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2005
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMyosinLamellipodiumCell biologyChemistryFibroblastActinMotilityIntegrinCell migrationBiophysicsCellBiochemistryBiologyIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Collagen remodelling by fibroblasts has a crucial role in organizing tissue structures that are essential to motility during wound repair, development and regulation of cell growth. However, the mechanism of collagen fibre movement in three-dimensional (3D) matrices is not understood. Here, we show that fibroblast lamellipodia extend along held collagen fibres, bind, and retract them in a 'hand-over-hand' cycle, involving alpha2beta1 integrin. Wild-type fibroblasts move collagen fibres three to four times farther per cycle than fibroblasts lacking myosin II-B (myosin II-B(-/-)). Similarly, myosin II-B(-/-) fibroblasts contract 3D collagen gels threefold less than controls. On two-dimensional (2D) substrates, however, rates of collagen bead and cell movement are not affected by loss of myosin II-B. Green fluorescent protein (GFP)-tagged myosin II-B, but not II-A, restores normal function in knockout cells and localizes to cell processes, whereas myosin II-A is more centrally located. Additionally, GFP-myosin II-B moves out to the periphery and back during hand-over-hand fibre movement, whereas on 2D collagen, myosin II-B is more centrally distributed. Thus, we suggest that cyclic myosin II-B assembly and contraction in lamellipodia power 3D fibre movements. PMID: 15654332

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,302
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,3020,219

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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