MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4246567862 · doi:10.1017/cjn.2019.82

GP.06 Differential microglia and macrophage profiles in human IDH-mutant and -wildtype glioblastoma reveal therapeutic vulnerabilities

2019· article· en· W4246567862 sur OpenAlexaffvenue
CC Poon, P Gordon, K Liu, R Yang, S Sarkar, V. Wee Yong, J Kelly

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensCalgary Laboratory Services
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIsocitrate dehydrogenaseMicrogliaWild typeMutantIDH1BiologyCD163PhenotypeCancer researchMolecular biologyInflammationGeneImmunologyGeneticsEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Microglia and macrophages (MMs) are the largest component of the inflammatory infiltrate in glioblastoma (GBM). However, whether there are immunophenotypic differences in isocitrate dehydrogenase (IDH)-mutated and -wildtype GBMs is unknown. Studies on specimens of untreated IDH-mutant GBMs are rare given they comprise 10% of all GBMs and often receive treatment at lower grades that can drastically alter MM phenotypes. Methods: We obtained large samples of untreated IDH-mutant and -wildtype GBMs. Using immunofluorescence techniques with single-cell automated segmentation, and comparison between single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) databases of human GBM, we discerned dissimilarities between GBM-associated MMs (GAMMs). Results: There are significantly fewer but more pro-inflammatory GAMMs in IDH-mutant GBMs, suggesting this contributes to the better prognosis of these tumors. Our pro-inflammatory score which combines the expression of inflammatory markers (CD68/HLA-A, -B, -C/TNF/CD163/IL10/TGFB2), Iba1 intensity, and GAMM surface area also indicates more pro-inflammatory GAMMs are associated with longer overall survival independent of IDH status. scRNA-seq analysis demonstrates microglia in IDH-mutants are mainly pro-inflammatory, while anti-inflammatory macrophages that upregulate genes such as FCER1G and TYROBP predominate in IDH-wildtype GBM. Conclusions: Taken together, these observations are the first head-to-head comparison of GAMMs in treatment-naïve IDH-mutant versus -wildtype GBMs that highlight biological disparities that can be exploited for therapeutic purposes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques→Même sujetGlioma Diagnosis and Treatment→Travaux en français237 207→