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Enregistrement W4247017462 · doi:10.1002/sita.200690010

Signalling Induced by Pathogens

2005· article· en· W4247017462 sur OpenAlexaff
Bernd Schmeck, Wolfgang Beermann, Vincent van Laak, J Zahlten, Bastian Opitz, M Witzenrath, Andreas C. Hocke, T Chakraborty, Michael Kracht, Norbert Suttorp, Stefan Hippenstiel, Christopher J. Ehrhardt, Henju Marjuki, Thorsten Wolff, Stephan Ludwig, Erwin Daniel Brenndörfer, Lars Frelin, Gustaf Ahlén, Catharina Hultgren, Mats Alheim, Hans Glaumann, David R. Milich, Matti Sällberg, Kerstin Gimborn, Gordon Grochowy, Christoph Kalis, Wolfgang G. Bessler, Chris Galanos, Gerald Krystal, Maria Huber

Notice bibliographique

RevueSignal Transduction · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCitationSignallingComputer scienceBiologyWorld Wide WebCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epigenetic histone modifications contribute to the regulation of eukaryotic gene transcription.The role of epigenetic regulation in immunity to intracellular pathogens is poorly understood.We tested the hypothesis that epigenetic histone modifications influence cytokine expression by intracellular bacteria.Intracellular L. monocytogenes, but not non-invasive L. innocua, induced release of distinct CC and CXC, as well as Th1 and Th2 cytokines and growth factors by endothelial cells.Cytokine-expression was in part dependent on p38 MAP kinase and MEK1.We analyzed global histone modification and modifications in detail at the gene-promoter of IL-8, which depended on both kinase pathways, and of IFNg, that was not blocked by kinase inhibition.Intracellular Listeria induced time-dependent acetylation (Lys-8) of histone H4 and phosphorylation/acetylation (Ser-10/Lys-14) of histone H3 globally and at the il8 promoter in HUVEC, as well as recruitment of histone acetylase CBP.Inhibitors of p38 MAP kinase and MEK1 reduced Lys-8-acetylation of histone H4 and Ser-10/Lys-14-phosphorylation/acetylation of histone H3 in Listeria-infected endothelial cells and disappearance of histone deactelyase HDAC1 at the il8 promoter in HUVEC.In contrast, IFNg gene transcription was activated by L. monocytogenes independently of p38 MAP kinase and MEK1, and histone phosphorylation/acetylation remained unchanged in infected cells at the IFNg promoter.Specific inhibition of histone deacetylases by trichostatin A increased Listeria-induced expression of IL-8, but not of IFNg, underlining the specific physiological impact of histone acetylation.In conclusion, MAP kinase-dependent epigenetic modifications differentially contributed to L. moncytogenes-induced cytokine expression by human endothelial cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
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Résumé présentoui

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