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Enregistrement W4247082056 · doi:10.1107/s0108767308091575

Crystal structure of α-carbonic anhydrase from<i>Chlamydomonas reinhardtii</i>

2008· article· en· W4247082056 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations of Crystallography · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme function and inhibition
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChlamydomonas reinhardtiiCarbonic anhydraseChlamydomonasChemistryCrystallographyBiochemistryEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Carbonic anhydrase (CA) plays important roles in biological processes such as photosynthesis, respiration, secretion of HCO3 -, pH homeostasis and ion exchange. The proteins commonly contain a zinc ion in the active site for catalyzing the hydration of CO2 and vice versa. It is known that there are three classes of CA, designated -, and -CAs, depending on the amino acid sequence similarities. The -class is different from others in the structural architecture. Furthermore, even in the -class, the enzyme from unicellular green alga, Chlamydomonas reinhardtii (chCA) is unique in posttranslational modifications that it is glycosylated and spliced into two peptides. Such glycosylations are found in only mammalian CAs but they are not spliced. To reveal the structural details and the role of N-glycosylation, an X-ray analysis of chCA has been performed. chCA is a homodimeric protein, the two subunits being crystallographically independent. In each subunit, residues from Ser298 to Asn345 are spliced to separate into long and short peptides. The two subunits are, however, linked together by a disulfide bond. In the catalytic site, a zinc ion is bound to the three conserved His163, His165 and His182 in a tetrahedral configuration. A water molecule is trapped at the fourth position of the Zn atom. The electron density maps indicate that N-glycosylations occur at the three sites, Asn101, Asn135 and Asn297. This structure is the first example of CA attached to N-glycosides. chCA molecules are interacted to each other with a six-fold screw symmetry to form a long column. Furthermore, they are fused through the lateral interactions like a beehive. Each catalytic site is exposed to the central tunnel. It suggests that chCA in the crystalline state also catalyze the reaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,594
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle