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Enregistrement W4247084733 · doi:10.3410/f.725832242.793543493

Faculty Opinions recommendation of Metabolic Modulation of Clear-cell Renal Cell Carcinoma with Dichloroacetate, an Inhibitor of Pyruvate Dehydrogenase Kinase.

2018· dataset· en· W4247084733 sur OpenAlexaboutno aff
Thomas W. Flaig

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2018
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAngiogenesisTFAMCancer researchApoptosisMitochondrionBiologyClear cell renal cell carcinomaGlycolysisWarburg effectPyruvate dehydrogenase kinaseCell growthHypoxia-inducible factorsIn vivoAnaerobic glycolysisPyruvate dehydrogenase complexEndocrinologyInternal medicineChemistryCell biologyMedicineRenal cell carcinomaBiochemistryMetabolismEnzymeMitochondrial biogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Clear-cell renal cell carcinoma (ccRCC) exhibits suppressed mitochondrial function and preferential use of glycolysis even in normoxia, promoting proliferation and suppressing apoptosis. ccRCC resistance to therapy is driven by constitutive hypoxia-inducible factor (HIF) expression due to genetic loss of von Hippel-Lindau factor. In addition to promoting angiogenesis, HIF suppresses mitochondrial function by inducing pyruvate dehydrogenase kinase (PDK), a gatekeeping enzyme for mitochondrial glucose oxidation.OBJECTIVE: To reverse mitochondrial suppression of ccRCC using the PDK inhibitor dichloroacetate (DCA).DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: Radical nephrectomy specimens from patients with ccRCC were assessed for PDK expression. The 786-O ccRCC line and two animal models (chicken in ovo and murine xenografts) were used for mechanistic studies.OUTCOME MEASUREMENTS AND STATISTICAL ANALYSIS: Mitochondrial function, proliferation, apoptosis, HIF transcriptional activity, angiogenesis, and tumor size were measured in vitro and in vivo. Independent-sample t-tests and analysis of variance were used for statistical analyses.RESULTS: PDK was elevated in 786-O cells and in ccRCC compared to normal kidney tissue from the same patient. DCA reactivated mitochondrial function (increased respiration, Krebs cycle metabolites such as α-ketoglutarate [cofactor of factor inhibiting HIF], and mitochondrial reactive oxygen species), increased p53 activity and apoptosis, and decreased proliferation in 786-O cells. DCA reduced HIF transcriptional activity in an FIH-dependent manner, inhibiting angiogenesis in vitro. DCA reduced tumor size and angiogenesis in vivo in both animal models.CONCLUSIONS: DCA can reverse the mitochondrial suppression of ccRCC and decrease HIF transcriptional activity, bypassing its constitutive expression. Its previous clinical use in humans makes it an attractive candidate for translation to ccRCC patients.PATIENT SUMMARY: We show that an energy-boosting drug decreases tumor growth and tumor blood vessels in animals carrying human kidney cancer cells. This generic drug has been used in patients for other conditions and thus could be tested in kidney cancer that remains incurable.Copyright © 2015 European Association of Urology. Published by Elsevier B.V. All rights reserved. PMID: 26433571 Funding information This work was supported by: Canadian Institutes of Health Research, Canada

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,398
Score d'incertitude au seuil0,859

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0050,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,3980,208

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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