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Enregistrement W4247116135 · doi:10.1016/s0021-9258(19)84095-4

Functional Characterization of a GJA1 Frameshift Mutation Causing Oculodentodigital Dysplasia and Palmoplantar Keratoderma

2006· article· en· W4247116135 sur OpenAlexaffabout
Xiang‐Qun Gong, Qing Shao, Crystal S. Lounsbury, Donglin Bai, Dale W. Laird

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPalmoplantar keratodermaFrameshift mutationMutationDermatologyMedicineGeneticsHyperkeratosisBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A frameshift mutation generated from a dinucleotide deletion (780-781del) in the GJA1 gene encoding Cx43 results in a frameshift yielding 46 aberrant amino acids after residue 259 and a shortened protein of 305 residues compared with the 382 in wild-type Cx43. This frameshift mutant (fs260) causes oculodentodigital dysplasia (ODDD) that includes the added condition of palmoplantar keratoderma. When expressed in a variety of cell lines, the fs260 mutant was typically localized to the endoplasmic reticulum and other intracellular compartments. The fs260 mutant, but not the G138R ODDD-linked Cx43 mutant or a Cx43 mutant truncated at residue 259 (T259), reduced the number of apparent gap junction plaques formed from endogenous Cx43 in normal rat kidney cells or keratinocytes. Interestingly, mutation of a putative FF endoplasmic reticulum retention motif encoded within the 46 aberrant amino acid domain failed to restore efficient assembly of the fs260 mutant into gap junctions. Dual whole cell patch-clamp recording revealed that fs260-expressing N2A cells exerted severely reduced electrical coupling in comparison to wild-type Cx43 or the T259 mutant, whereas single patch capacitance recordings showed that fs260 could also dominantly inhibit the function of wild-type Cx43. Co-expression studies further revealed that the dominant negative effect of fs260 on wild-type Cx43 was dose-dependent, and at a predicted 1:1 expression ratio the fs260 mutant reduced wild-type Cx43-mediated gap junctional conductance by over 60%. These results suggest that the 46 aberrant amino acid residues associated with the frameshift mutant are, at least in part, responsible for the manifestation of palmoplantar keratoderma symptoms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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