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Enregistrement W4247221648 · doi:10.3390/proceedings2020050116

KSHV Activates Unfolded Protein Response Sensors but Suppresses Downstream Transcriptional Responses to Support Lytic Replication

2020· article· en· W4247221648 sur OpenAlexaff
Benjamin P. Johnston, Eric S. Pringle, Craig McCormick

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUnfolded protein responseATF6XBP1Lytic cycleCell biologyEndoplasmic reticulumATF4BiologyOncolytic virusTranscription factorViral replicationVirologyGeneRNA splicingVirusRNABiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Herpesviruses usurp host cell protein synthesis machinery to convert viral mRNAs into proteins, and the endoplasmic reticulum (ER) to ensure the proper folding, post-translational modification and trafficking of secreted and transmembrane viral proteins. Overloading the ER folding capacity activates the unfolded protein response (UPR), whereby sensor proteins, ATF6, PERK and IRE1, initiate a stress-mitigating transcription program that accelerates the catabolism of misfolded proteins, while increasing the ER folding capacity. Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) can be reactivated from latency through the chemical induction of ER stress, which causes an accumulation of the XBP1s transcription factor that transactivates the viral RTA lytic switch gene. The presence of XBP1s-responsive elements in the RTA promoter suggests that KSHV evolved a mechanism to respond to ER stress. Here, we report that ATF6, PERK and IRE1 were activated upon reactivation from latency and were required for efficient KSHV lytic replication. The genetic or pharmacologic inhibitions of each UPR sensor reduced virion production. Despite UPR sensor activation during KSHV lytic replication, downstream UPR transcriptional responses were restricted: (1) ATF6 was cleaved to activate the ATF6(N) transcription factor but ATF6(N)-responsive genes were not transcribed; (2) PERK phosphorylated eIF2, but ATF4 did not accumulate; (3) IRE1 caused XBP1–mRNA splicing, but the XBP1s protein did not accumulate and the XBP1s-responsive genes were not transcribed. The complementation of XBP1s deficiency during KSHV lytic replication inhibited virion production in a dose-dependent manner in epithelial cells. Taken together, these findings indicate that, while XBP1s plays an important role in reactivation from latency, it can inhibit virus replication at a later step, which the virus overcomes by preventing its synthesis. These findings suggest that KSHV hijacks UPR sensors to promote efficient viral replication while sustaining ER stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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