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Enregistrement W4247242596 · doi:10.1093/jcag/gwy009.139

A139 AGREEMENT OF IBDOC® AND QUANTON CAL® RAPID LATERAL FLOW-BASED FECAL CALPROTECTIN TESTS WITH ACCEPTED LAB-BASED ASSAYS FOR MONITORING INFLAMMATORY BOWEL DISEASE

2018· article· en· W4247242596 sur OpenAlexaffabout
Reed T. Sutton, Connie Prosser, Neil Dhami, Daniel Sadowski, Sander van Zanten, Karen I. Kroeker, K Wong, Brendan P. Halloran, Richard N. Fedorak, Vivian Huang

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalprotectinMedicinePoint-of-care testingInflammatory bowel diseaseInternal medicineGastroenterologySurgeryDiseaseImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fecal calprotectin (FCP) is a useful biomarker for monitoring inflammatory bowel disease, showing good correlation to endoscopic disease activity. Currently used lab tests take 2–4 weeks to return a result, limiting their usefulness. Recently, lateral flow-based rapid tests have been combined with smartphone applications to allow patients to complete FCP testing at home, with their physician receiving the result the same day. We aim to compare FCP results from two point-of-care test (POCT) devices (IBDoc; Buhlmann, Quanton Cal; Preventis) in real world use, to two widely accepted lab based methods. Patients brought first morning stool to the University of Alberta IBD clinic, completed partial Mayo (pMayo) and Harvey-Bradshaw index (mHBI) scores, received training, and performed the IBDoc test. A portion of their raw sample was sent to the hospital lab, stored at -20°C, thawed and then analyzed using Quanton Cal POCT kits (performed by laboratory staff) and two weight-based lab tests: Immunodiagnostik (ELISA) and Buhlmann Turbo (immunoturbidimetric) assays. Numerical FCP values were tabulated and dichotomized by ≥250 µg/ml (active) or <250 µg/ml (remission). Clinical scores were dichotomized as symptomatic if mHBI≥5 or pMayo≥2. Twenty patients provided raw stool and completed the IBDoc test, including 12 (60.0%) females and 9 (45.0%) with Crohn’s disease. The median age is 33.5 years (IQR: 29.5 to 37.5). Maintenance medications: 3 (15.0%) taking no medications, 4 (20.0%) on 5-ASA, 4 (20.0%) on immunomodulators, 9 (45.0%) on biologics, of whom 3 (15.0%) were on biologic combotherapy. Median FCP values and IQRs for all four tests are shown in Figure 1. Spearman’s correlation with results from Immunodiagnostik was 0.93 for IBDoc, 0.89 for Quanton Cal, and 0.97 for Buhlmann Turbo. Upon dichotomizing FCP as active or inactive, 18/20 (90%) of results were in agreement between IBDoc and Immunodiagnostik, 19/20 (95%) between Quanton Cal and Immunodiagnostik, and 19/20 (95%) between IBDoc and Quanton Cal. However; pMayo/mHBI and FCP were not as agreeable with 12/20 (60%) reaching the same conclusion (symptomatic or asymptomatic) for IBDoc, 13/20 (65%) for Quanton Cal, and 14/20 (70%) for Immunodiagnostik. There is good correlation between POCTs and lab tests at <250 µg/ml, although correlation was better between the two lab tests. POCTs can differentiate disease activity from remission and can be performed remotely, an advantage for rural patients. The quantitative values >250 µg/ml are not reproducible and would be misleading if used to monitor disease progression. FCP close to cutoffs should be repeated and does not correlate very well with patient reported symptoms. None

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,038
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,066
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,202

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0380,066
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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