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Enregistrement W4247468237 · doi:10.21203/rs.3.rs-89421/v1

Microbiomes of clownfish and their symbiotic host anemone converge before their first physical contact

2020· preprint· en· W4247468237 sur OpenAlexafffund
Émie Audet Gilbert, François‐Étienne Sylvain, Sidki Bouslama, Nicolas Derôme

Notice bibliographique

RevueResearch Square (Research Square) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine Invertebrate Physiology and Ecology
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesUniversité Laval
Mots-clésAnemoneSea anemoneBiologyEcologySymbiosisZoologyAstrobiologyBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background One of the most charismatic, and yet not completely resolved example of mutualistic interaction is the partnership of clownfish and its symbiotic sea anemone. The mechanism explaining this tolerance currently relies on the molecular mimicry of clownfish epithelial mucus, which could serve as camouflage, preventing the anemone's nematocysts' discharge. Resident bacteria are known as key drivers of epithelial mucus chemical signature in vertebrates. A recent study has proposed a restructuration of the skin microbiota in a generalist clown fish when first contacting its symbiotic anemone. We explored a novel hypothesis by testing the effect of remote interaction on epithelial microbiota restructuration in both partners. Methods With metataxonomics, we investigated the epithelial microbiota dynamic of 18 pairs of percula clownfish ( Amphiprion percula ) and their symbiotic anemone Heteractis magnifica in remote interaction, physical interaction and control groups for both partners during a four weeks trial. Results Physical and Remote Interaction groups’ results evidence gradual epithelial microbiota convergence between both partners when fish and anemone were placed in the same water system. This convergence occurred preceding any physical contact between partners, and was maintained during the two-weeks interaction period in both contact groups. After the interaction period, community structure of both fish and anemone’s epthelial community structures maintained the interaction signature two weeks after fish-anemone pairs separation. Furthermore, the interaction signature persistence was observed both in Physical and Remote Interaction groups, thus suggesting that water-mediated chemical communication between symbiotic partners was strong enough to shift the skin microbiota durably, even after the separation of fish-anemone pairs. Finally, our results suggest that fish-anemone convergent microbiota restructuration was increasingly associated with the parallel recruitment of three Flavobacteriaceae strains closely related to a tyrosinase-producing Cellulophaga tyrosinoxydans . Conclusions Our study shows that bacterial community restructuration, in the acclimation process, does not only rely on direct physical contact. Furthermore, our results challenge, for the first time, the traditional unidirectional chemical camouflage hypothesis, as we argue that convergence of the epithelial microbiota of both partners may play essential roles in establishing mutual acceptance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,053
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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