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Enregistrement W4247536710 · doi:10.1093/annonc/mdx805

correction to: Pathway level alterations rather than mutations in single genes predict response to HER2-targeted therapies in the neo-ALTTO trial

2018· erratum· en· W4247536710 sur OpenAlexaff
W. Shi, T. Jiang, P. Nuciforo, Christos Hatzis, E. Holmes, N. Harbeck, C. Sotiriou, Laiane da Cruz Pena, S. Loi, Daniele Rosa, S. Chia, Andrew Wardley, T. Ueno, J. Rossari, H. Eidtmann, A. Armour, M. Piccart-Gebhart, David L. Rimm, J. Baselga, L. Pusztai

Notice bibliographique

RevueAnnals of Oncology · 2018
Typeerratum
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthBreast Cancer Research FoundationYale UniversityU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésMedicineExomeGeneExome sequencingGeneticsOncologyTargeted therapyMutationBioinformaticsCancerComputational biologyInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ann Oncol 2017; 28: 128–135 (doi: 10.1093/annonc/mdw434) In the original article, the following funding information was omitted: ‘This research was funded in part through the NIH/NCI Cancer Center Support Grant P30 CA008748’. This has now been added. Pathway level alterations rather than mutations in single genes predict response to HER2-targeted therapies in the neo-ALTTO trialAnnals of OncologyVol. 28Issue 1PreviewWe performed whole-exome sequencing of pretreatment biopsies and examined whether genome-wide metrics of overall mutational load, clonal heterogeneity or alterations at variant, gene, and pathway levels are associated with treatment response and survival. Full-Text PDF Open Archive

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,078
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Essai non randomisé · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,093
Score d'incertitude au seuil0,310

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,078
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0050,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0930,031

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeEssai non randomisé
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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