Nodule-Specific Regulation of Phosphatidylinositol Transfer Protein Expression in <i>Lotus japonicus</i>
Notice bibliographique
Résumé
Phosphatidylinositol transfer proteins (PITPs) modulate signal transduction pathways and membrane-trafficking functions in eukaryotes. Here, we describe the characterization of a gene family from Lotus japonicus that encodes a novel class of plant PITP-like proteins (LjPLPs) and that is regulated in an unusual nodule-specific manner. Members of this gene family were identified based on their nucleotide sequence homology with a previously described cDNA, LjNOD16, which encodes the L. japonicus late nodulin Nlj16. Nlj16 or highly related amino acid sequences are shown to constitute C-terminal domains of LjPLPs and are suggested to function as specific plasma membrane targeting modules. The expression patterns of one member of this gene family (LjPLP-IV) revealed that LjNOD16 mRNA synthesis in nodules is the result of the transcriptional activity of a nodule-specific promoter located in an intron of the LjPLP-IV gene. This intron-borne bidirectional promoter also generates nodule-specific antisense transcripts derived from the N-terminal PITP domain coding region of the LjPLP-IV gene. We propose that Nlj16 protein synthesis and LjPLP-IV antisense transcript generation are components of an elaborate mechanism designed to control LjPLP synthesis and/or functioning in nodules.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».