Transcriptome profiling provides new insights into florets number difference of inflorescence in L.angustifolia
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Lavender flowers essential oil had been used for a variety of therapeutic and cosmetic purposes, and had been popular for centuries. The previous studies of lavender mainly focused on essential oil composition and extraction methods, ignoring the factors that affected the production of essential oils, such as the floret number. This study aims to get a deep insight into the mechanism of florets number difference. Results 1.Hormone profile showed positive correlation between ABA content and the number of florets, while IAA was negatively correlated. 2. RNA-Seq results showed that 2848 differentially expressed genes (DEG) were screened by comparing different florets samples in one plant. By analyzing dynamic changes of differentially expressed genes, many potentially interesting genes that encoded putative regulators or key components of ABA metabolism and signaling transduction were identified, such as NCED, PYL, PP2C, SnRK2. 3.Common network analysis showed that the key genes of ABA pathway metabolism were negatively related to the DEG of IAA, especial IAA18. 4. Exogenous IAA significantly inhibited the number of lavender florets and affected the expression of ABA pathway metabolism genes, such as NCED, PP2C.Conclusions 1. The different concentrations of ABA lead to florets number difference in the L.angustifolia “JX-2” clusters; 2. ABA may affect the florets number by regulating IAA transport and accumulation.The results will be useful for a better understanding of the molecular mechanism on florets number difference, which will lay the foundation for molecular breeding of muti-flortes varieties.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».