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Enregistrement W4248123634 · doi:10.1101/2021.09.09.21263362

Study of effect modifiers of genetically predicted CETP reduction

2021· preprint· en· W4248123634 sur OpenAlexafffundabout
Marc‐André Legault, Amina Barhdadi, Isabel Gamache, Audrey Lemaçon, Louis‐Philippe Lemieux Perreault, Jean‐Christophe Grenier, Marie‐Pierre Sylvestre, Julie Hussin, David Rhainds, Jean‐Claude Tardif, Marie‐Pierre Dubé

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéPfizerInstitut de Cardiologie de MontréalInstitut de Valorisation des DonnéesCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaUniversité de Montréal
Mots-clésBiobankBody mass indexCholesterolObservational studyMedicineInternal medicineBioinformaticsEndocrinologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Genetic variants in drug targets can be used to predict the effect of drugs. Here, we extend this principle to assess how sex and body mass index may modify the effect of a genetically predicted lower CETP levels on biomarkers and cardiovascular outcomes. We found sex and BMI to be modifiers of the association between genetically predicted lower CETP and lipid biomarkers in UK Biobank participants. Female sex and lower BMI were associated with higher HDL-cholesterol and lower LDL-cholesterol for a same genetically predicted reduction in CETP concentration. We found that sex also modulated the effect of genetically lower CETP on cholesterol efflux capacity in samples from the Montreal Heart Institute Biobank. However, these modifying effects did not extend to sex-differences in cardiovascular outcomes in our data. Our results provide insight on the clinical effects of CETP inhibitors in the presence of effect modification based on observational genetic data. The approach can support precision medicine applications and help assess the external validity of clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,022
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,044

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,022
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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