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Enregistrement W4248153717 · doi:10.1093/neuonc/nox083.163

MEDU-12. CD271 (P75NTR) AS A NOVEL DIAGNOSTIC MARKER AND THERAPEUTIC TARGET FOR SHH MEDULLOBLASTOMA

2017· article· en· W4248153717 sur OpenAlexaff
Lisa Liang, Ludivine Coudière-Morrison, Nazanin Tatari, Vijay Ramaswamy, Timothy C. Ryken, Marc R. Del Bigio, Cynthia Hawkins, Jennifer A. Chan, Tamra E. Werbowetski‐Ogilvie

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of CalgaryHospital for Sick ChildrenUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLow-affinity nerve growth factor receptorBiologyCancer researchWnt signaling pathwayCell biologySignal transductionNeurotrophinReceptorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Medulloblastoma (MB) is the most common malignant primary brain tumor and is currently classified into 5 distinct molecular subtypes based on genomic alterations, gene expression profile, response to treatment and cell of origin. This extensive heterogeneity has revealed a critical need for subtype-specific, functionally validated biomarkers and therapeutic strategies. Using an unbiased high throughput flow cytometry screen and gain/loss of function studies, we previously identified CD271/p75NTR as a candidate stem/progenitor cell marker, specifically in SHH MB. Here, we show that CD271+ and CD271- subpopulations do not exhibit a hierarchal organization; but are rather two co-existing cellular subsets. FACS sorting followed by re-culturing of CD271- and CD271+ cells from low passage primary cultures demonstrated that both cell populations can recapitulate the parental phenotype. However, global gene expression profiling by RNA sequencing revealed that genes/pathways associated with cell survival, proliferation and motility are downregulated in CD271- vs. CD271+ subpopulations. Cell cycle analysis supported these findings and demonstrated that CD271- cells exhibited a decrease in proliferation compared to CD271+ cells. Moreover, PI3K/AKT, JAK/STAT, and NFkB, are downregulated in CD271- vs. CD271+ cells, while pathways such as RAS/MYC are upregulated in CD271- vs. CD271+ cells. Immunohistochemical (IHC) analysis of CD271 levels across the MB subtypes demonstrated that nearly all SHH tumors express CD271, while Group 3 tumors exhibit moderate staining. In contrast, Group 4 MB and WNT do not express CD271. Importantly SHH MB exhibit a nodular CD271 staining pattern, further underscoring the heterogeneity within these tumors and supporting our findings that CD271- and CD271+ cells are distinct, yet clinically relevant, subpopulations. Our results suggest that CD271, in combination with other markers, could be effectively utilized as a diagnostic tool for SHH MB and that therapeutic strategies concomitantly targeting both CD271+ and CD271- subpopulations would be the most effective in SHH MB treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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