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Enregistrement W4248158530 · doi:10.26434/chemrxiv.13484763

Hinge Binder Scaffold Hopping Identifies Potent Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase Kinase 2 (CAMKK2) Inhibitor Chemotypes

2020· preprint· en· W4248158530 sur OpenAlexaff
Benjamin J. Eduful, Sean O’Byrne, Louisa Temme, Christopher R. M. Asquith, Yi Liang, Alfredo Picado, Joseph Pilotte, Carrow I. Wells, William J. Zuercher, Carolina Moura Costa Catta‐Preta, Priscila Zonzini Ramos, André da Silva Santiago, Rafael M. Couñago, Christopher G. Langendorf, Kévin Nay, Jonathan S. Oakhill, Thomas L. Pulliam, Chenchu Lin, Dominik Awad, Timothy M. Willson, Daniel E. Frigo, John W. Scott, David H. Drewry

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueQuinazolinone synthesis and applications
Établissements canadiensStructural Genomics Consortium
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésChemistryKinaseBiochemistryProtein kinase ASerineEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<div>CAMKK2 is a serine/threonine kinase and an activator of AMPK whose dysregulation is linked with multiple diseases. Unfortunately, STO-609, the tool inhibitor commonly used to probe CAMKK2 signaling, has limitations. To identify promising scaffolds as starting points for the development of high-quality CAMKK2 chemical probes, we utilized a hinge-binding scaffold hopping strategy to design new CAMKK2 inhibitors. Starting from the potent but promiscuous disubstituted 7-azaindole GSK650934 (CAMKK2 IC50 = 3 nM), a total of 32 compounds, composed of single ring, 5,6-, and 6,6-fused heteroaromatic cores were synthesized. The compound set was specifically designed to probe interactions with the kinase hinge-binding residues. These compounds were evaluated in vitro in biochemical and cellular assays for CAMKK2 inhibition. Compared to GSK650394 and STO-609, thirteen of our compounds displayed similar or better CAMKK2 inhibitory potency in vitro, while compounds 13g and 45 had greatly improved selectivity for CAMKK2 across the kinome. Our systematic survey of hinge binding chemotypes identified several potent and selective inhibitors of CAMKK2 to serve as starting points for medicinal chemistry programs aimed at the identification of CAMKK2 chemical probes and clinical candidates<br></div>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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