Integration and Persistence of Escherichia Coli O157:H7 86-24 in a Naturally-Occurring Water Well Biofilm
Notice bibliographique
Résumé
Studies to determine how a microbe can persist in a foreign environment are essential in understanding water contamination by infectious agents. Annular reactors were designed, constructed, and used as a laboratory-based model to study naturally-occurring biofilms. Untreated groundwater was used a s the bulk liquid, and a foreign microbe with a green fluorescent protein (GFP) marker was introduced. It was demonstrated that under oligotrophic conditions Escherichia coli O157:H7 86-24 did not grow planktonically. The microbe demonstrated an ability to integrate into the existing biofilm. Various environmentally-relevant concentrations of nitrogen and phosphate were also used to detect any effects on its persistence. The results suggest that the persistence of the E. coli O157:H7 86-24 was enhanced when the bulk fluid was amended to contain 100 ppm nitrate, and hindered when phosphate was added. To utilize available molecular tools, polymerase chain reaction (PCR) coupled with denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC) were used. It was found that the E. coli O157:H7-specific primers were not as reliable in detecting E.coli O157 within the biofilm when compared to detection using the GFP marker. PCR using 16S rRNA primers were also used to gain insight into the microbial diversity of the biofilm.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».