Peer Review #3 of "The photo-inhibition of camphor leaves (Cinnamomum camphora L.) by NaCl stress based on physiological, chloroplast structure and comparative proteomic analysis (v0.1)"
Notice bibliographique
Résumé
Background.The distribution and use of Camphor (Cinnamomum camphora L.) trees are constrained by increasing soil salinity in south-eastern China along the Yangtze River.However, the response mechanism of this species to salinity, especially in team of photosynthesis, are unknown. Methods.Here, we analysed the morphological, physiological, ultrastructural, and proteomic traits of camphor seedlings under NaCl (103.45 mM) treatment in pot experiments for 80 days.Results.The growth was limited because of photosynthetic inhibition, with the most significant disturbance occurring within 50 days.Salinity caused severe reductions in the leaf photosynthetic rate (A n ), stomatal conductance (g s ), maximal chlorophyll fluorescence (F m ), maximum quantum yield of PSII (F v /F m ), non-photochemical quenching (NPQ), relative quantum efficiency of PSII photochemistry (ΦPSII), photochemical quenching coefficient (qP) and photo-pigment contents (chlorophyll a (Cha), chlorophyll b (Chb), total chlorophyll (Chl)); weakened the antioxidant effects, including those of malondialdehyde (MDA), superoxide dismutase (SOD) and peroxidase (POD); and injured chloroplasts.The physiological resultsindicated that the main reason for photo-inhibition was oxidative factors induced by NaCl.The proteomic results based on isobaric tags for relative and absolute quantitation (iTRAQ) further confirmed that photosynthesis was the most significant disrupted process by salinity (P<0.01) and there were 30 downregulated differentially expression proteins (DEPs) and one upregulated DEP related to restraint of the photosynthetic system, which affected photosystem Ι, photosystem II, the Cytochrome b6/f complex, ATP synthase and the light-harvesting chlorophyll protein complex.In addition, 57 DEPs were related to photo-inhibition by redox effect and 6 downregulated DEPs, including O2 evolving complex 33kD family protein (gi|224094610) and 5PeerJ reviewing
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,010 | 0,053 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,005 | 0,001 |
| Communication savante | 0,007 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,281 | 0,177 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».