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Enregistrement W4248784733 · doi:10.22215/etd/2020-14126

The Robotic Molecular Biologist -Automated Processing of Astrobiological Samples for Planetary Missions

2020· dissertation· en· W4248784733 sur OpenAlexafffund
Shubhank Sondhiya

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMicrofluidic and Capillary Electrophoresis Applications
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesCanadian Space AgencyFast Grants
Mots-clésMicrofluidicsMars Exploration ProgramExploration of MarsAerospace engineeringAstrobiologyComputer scienceEngineeringEnvironmental scienceNanotechnologyPhysicsMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nanopore based DNA sequencing is becoming more prevalent in life-detection platforms, and the search for life in our solar system is a major focus of planetary exploration.One of the key challenges is the development of a suite of life detection instruments with lower mass and energy requirements.The aim of this research is the development of a low-mass and robust life detection platform that has the potential to be integrated into future astrobiology space missions and to perform numerical analysis to optimize the platform.To achieve this, a subset of instruments that could be deployed on a Mars rover are examined and a novel stand-alone life detection platform is designed that is equipped with peristaltic pumps, solenoid valves, microfluidic chip, Microbial Activity MicroAssay (µ-MAMA) and an Automated Nucleic Acid Extraction System (A-NECS).Further, a control algorithm is developed to perform an end-to-end analysis of DNA/RNA extraction and microbial activity detection on the environmental sample collected.A mathematical model for predicting the flow patterns in microfluidics is presented and a CFD analysis of the lysing chamber is conducted to understand turbulent properties, volume density distributions of the dissipated energy and the agitation rate effects.MRF method is used for calculations and two different zones of the lysing chamber are investigated.It is found to improve the accuracy in the prediction of the results without increasing the overall cost, mass, energy consumption of the instrument suite.Further, the results obtained in the thesis indicate that the automated life-detection platform performed significantly well and microbial activity was detected in the sample tested.iii List of Tables 3.1 Micropump parameters and their specifications. . . . . . . . . . . .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,071

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0210,017

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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