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Enregistrement W4248856297 · doi:10.1042/bj3530387

Identification of Cys140 in helix 4 as an exofacial cysteine residue within the substrate-translocation channel of rat equilibrative nitrobenzylthioinosine (NBMPR)-insensitive nucleoside transporter rENT2

2001· article· en· W4248856297 sur OpenAlexaff
Sylvia Y.M. Yao, Manickavasagam Sundaram, Eugene G. Chomey, Carol E. Cass, Stephen A. Baldwin, James D. Young

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdenosine and Purinergic Signaling
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleoside transporterNucleosideTransmembrane domainUridineBiochemistryCysteineChemistryTransporterBiologyEnzymeRNAMembraneGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human and rat equilibrative nucleoside transporter proteins hENT1, rENT1, hENT2 and rENT2 belong to a family of integral membrane proteins with 11 potential transmembrane segments (TMs), and are distinguished functionally by differences in transport of nucleobases and sensitivity to inhibition by nitrobenzylthioinosine (NBMPR) and vasoactive drugs. In the present study, we have produced recombinant hENT1, rENT1, hENT2 and rENT2 in Xenopus oocytes and investigated uridine transport following exposure to the impermeant thiol-reactive reagent p-chloromercuriphenyl sulphonate (PCMBS). PCMBS caused reversible inhibition of uridine influx by rENT2, but had no effect on hENT1, hENT2 or rENT1. This difference correlated with the presence in rENT2 of a unique Cys residue (Cys140) in the outer half of TM4 that was absent from the other ENTs. Mutation of Cys140 to Ser produced a functional protein (rENT2/C140S) that was insensitive to inhibition by PCMBS, identifying Cys140 as the exofacial Cys residue in rENT2 responsible for PCMBS inhibition. Uridine protected wild-type rENT2 against PCMBS inhibition, suggesting that Cys140 in TM4 lies within or is closely adjacent to the substrate-translocation channel of the transporter. TM4has been shown previously to be within a structural domain (TMs 3Ő6) responsible for interactions with NBMPR, vasoactive drugs and nucleobases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,594

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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