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Enregistrement W4248989583 · doi:10.1080/07060661.2019.1653376

Physiological specialization of <i>Puccinia triticina</i>, the causal agent of wheat leaf rust, in Canada in 2013

2019· article· en· W4248989583 sur OpenAlexaffvenueabout
Brent McCallum, P. Seto-Goh, Elsa Reimer, Adam Foster, Allen Xue

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirulenceWheat leaf rustPuccinia reconditaPhenotypeBiologyRust (programming language)Common wheatCultivarGeneBotanyGeneticsChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wheat leaves infected with leaf rust collected across Canada in 2013 were used to isolate 265 Puccinia triticina Eriks. single uredinial isolates. When these were analysed for virulence on 16 standard differential wheat lines 38 virulence phenotypes were found, with MBDS (11.7%), TBBG (11.3%), TNBG (10.2%) and MBTN (8.3%) the most common. In Manitoba and Saskatchewan, 29 virulence phenotypes were found among 236 isolates, with MBDS (13.1%), TBBG (12.7%) and TNBG (11.4%) being the most common. From Ontario, four virulence phenotypes MBTN (73.7%), LCDN (10.5%), MGPS (10.5%) and TCRJ (5.3%) were determined among 19 isolates. There were 10 isolates from Prince Edward Island which grouped into seven different virulence phenotypes, the most common being MBNQ (three isolates) and MCNQ (two isolates). The frequencies of virulence to Lr9, Lr26, Lr3ka, Lr17, Lr30, Lr14a and Lr21 increased, and virulence to Lr2a, Lr2c, Lr16, Lr24, Lr11, Lr10 and Lr18 decreased, when compared with 2012. The increase in virulence frequency to Lr21 is important since many Canadian wheat cultivars have this gene, and could become more susceptible. There were no virulence phenotypes in common between Ontario and Prince Edward Island, and only one virulence phenotype from each of these regions was found in the larger sample from Manitoba and Saskatchewan, demonstrating the differences in the populations across Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,101

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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