Physiologic specialization of<i>Puccinia triticina</i>, the causal agent of wheat leaf rust, in Canada in 2006
Notice bibliographique
Résumé
Puccinia triticina, the causal agent of wheat leaf rust, was collected from across Canada in 2006 to determine the virulence spectrum of this pathogen. From 353 single-pustule isolates, 31 virulence phenotypes were identified. There were 20 virulence phenotypes among 315 isolates from Manitoba and Saskatchewan. The most common phenotypes were TDBG (56.2%), TDBJ (18.7%), and MFPS (5.4%). The frequency of virulence to Lr24 (86.3%) was very high, whereas it was very low for Lr16 (0.3%) when compared with years prior to 2005. From 19 isolates collected in Ontario, 14 isolates were MFDS; 2 were TBDS; and 1 isolate each were MBMR, MDNS, and TFPJ. MFDS was the only virulence phenotype identified from three isolates collected in Quebec. There was a similar rise in 2006 in the frequency of virulence to Lr24 in Ontario (84.2%) and Quebec (100%), although different virulence phenotypes were responsible for this increase in eastern Canada compared with western Canada. Nine virulence phenotypes were identified among 16 isolates from Prince Edward Island (PEI). The most common of these were MCPR (four isolates), MBPR (three isolates), and MBDS and MDDS (two isolates each). Five of these nine virulence phenotypes were not found in the rest of Canada in 2006 nor in the past 5 years. This is an indication that the PEI population is somewhat distinct from those in the other regions of Canada. When 50 isolates representing most of the virulence phenotypes and the different regions in Canada were inoculated onto adult plants, there were 47, 45, 1, and 30 isolates virulent to Lr12, Lr13, Lr35, and Lr37, respectively. These 50 representative isolates were also inoculated on 12 additional ‘Thatcher’ near-isogenic lines at the seedling stage, and there were 25, 46, 48, 50, 43, 43, 2, and 25 isolates virulent to Lr2b, Lr3bg, Lr14b, Lr15, Lr20, Lr23, Lr25, and Lr28, respectively. All isolates tested were avirulent to Lr19, Lr21, Lr22a, Lr29, Lr32, and Lr34
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».