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Enregistrement W4249585808 · doi:10.1080/07060660909507575

Physiologic specialization of<i>Puccinia triticina</i>, the causal agent of wheat leaf rust, in Canada in 2006

2009· article· en· W4249585808 sur OpenAlexaffvenueabout
Brent McCallum, P. Seto-Goh

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesMinistry of Food and Drug Safety
Mots-clésVirulencePhenotypeBiologyPathogenWheat leaf rustInoculationRust (programming language)Puccinia reconditaPopulationMicrobiologyBotanyGeneticsPoaceaeGeneHorticultureMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Puccinia triticina, the causal agent of wheat leaf rust, was collected from across Canada in 2006 to determine the virulence spectrum of this pathogen. From 353 single-pustule isolates, 31 virulence phenotypes were identified. There were 20 virulence phenotypes among 315 isolates from Manitoba and Saskatchewan. The most common phenotypes were TDBG (56.2%), TDBJ (18.7%), and MFPS (5.4%). The frequency of virulence to Lr24 (86.3%) was very high, whereas it was very low for Lr16 (0.3%) when compared with years prior to 2005. From 19 isolates collected in Ontario, 14 isolates were MFDS; 2 were TBDS; and 1 isolate each were MBMR, MDNS, and TFPJ. MFDS was the only virulence phenotype identified from three isolates collected in Quebec. There was a similar rise in 2006 in the frequency of virulence to Lr24 in Ontario (84.2%) and Quebec (100%), although different virulence phenotypes were responsible for this increase in eastern Canada compared with western Canada. Nine virulence phenotypes were identified among 16 isolates from Prince Edward Island (PEI). The most common of these were MCPR (four isolates), MBPR (three isolates), and MBDS and MDDS (two isolates each). Five of these nine virulence phenotypes were not found in the rest of Canada in 2006 nor in the past 5 years. This is an indication that the PEI population is somewhat distinct from those in the other regions of Canada. When 50 isolates representing most of the virulence phenotypes and the different regions in Canada were inoculated onto adult plants, there were 47, 45, 1, and 30 isolates virulent to Lr12, Lr13, Lr35, and Lr37, respectively. These 50 representative isolates were also inoculated on 12 additional ‘Thatcher’ near-isogenic lines at the seedling stage, and there were 25, 46, 48, 50, 43, 43, 2, and 25 isolates virulent to Lr2b, Lr3bg, Lr14b, Lr15, Lr20, Lr23, Lr25, and Lr28, respectively. All isolates tested were avirulent to Lr19, Lr21, Lr22a, Lr29, Lr32, and Lr34

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,098

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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