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Enregistrement W4249843277 · doi:10.1093/ndt/gfs072

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2012· article· en· W4249843277 sur OpenAlexaff
Shubha S. Bellur, Stéphan Troyanov, H. Terence Cook, Ian S.D. Roberts

Notice bibliographique

RevueNephrology Dialysis Transplantation · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensHôpital du Sacré-Cœur de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sir, As Dr Mubarak correctly observes, the study of immunohistological findings in the Oxford Classification of IgA nephropathy cohort [1] is based on review of the original pathology reports and not of the slides. This was necessary, as there was no access to the original diagnostic material which, in almost all cases, was immunofluorescence (IMF) on frozen sections. As a result, the quality of immunohistological data was potentially limited by interobserver variation between the reporting pathologists. In view of this methodological flaw, it is particularly impressive that strong correlations were found between the IMF findings and light microscopical changes. We agree that if immunohistology is to be included in a classification of IgA nephropathy, then the issue of IMF definitions and reproducibility first needs to be addressed. Whilst there are several studies that have assessed interobserver agreement in the interpretation of the histological changes in renal diseases [2–4], there are few such studies applied to renal immunohistology. Interobserver concordance in the interpretation of C4d and SV40 T-antigen positivity in renal transplant biopsies has recently been reported [5, 6]. Similar studies applied to glomerular IMF and immunohistochemistry in native renal disease are lacking. Some researchers suggest that image analysis is superior to subjective interpretation of renal IMF. Interestingly, a recent study reported that, in IgA nephropathy, the presence of adverse histological prognostic features correlated with intensity and total optical density of fluorescence measured using image analysis software, but not with semiquantitative scoring [7]. Electron microscopy (EM) was not included in the Oxford Classification because neither the reports nor the images were available for most biopsies. We agree that further investigation of the ultrastructural changes in IgA nephropathy is required, in particular correlation with light microscopy and clinical outcome. The future inclusion of ultrastructural features in the Oxford Classification will depend on evidence that EM provides added clinical value. Such evidence is lacking at present, reflected in the limited use of EM in many centres. Conflict of interest statement. None declared.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,042
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,042
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0040,003
Communication savante0,0060,005
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0400,040
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0200,014

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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