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Enregistrement W4249987803 · doi:10.7554/elife.29213.032

Author response: Detection of human disease conditions by single-cell morpho-rheological phenotyping of blood

2017· peer-review· en· W4249987803 sur OpenAlexaff
Nicole Toepfner, C. Herold, Oliver Otto, Philipp Rosendahl, Angela Jacobi, Martin Kräter, Julia Stächele, Leonhard Menschner, Maik Herbig, Laura Ciuffreda, Lisa Ranford‐Cartwright, Michał Grzybek, Ünal Coskun, Elisabeth Reithuber, Geneviève Garriss, Peter Mellroth, Birgitta Henriques‐Normark, Nicola Tregay, Meinolf Suttorp, Martin Bornhäuser, Edwin R. Chilvers, Reinhard Berner, Jochen Guck

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood properties and coagulation
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiseaseMedicineComputer scienceInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

When you are sick and go to the doctor, it is often not obvious what exactly is wrong — what is causing fever, nausea, shortness of breath or other symptoms. It is important to find this out quickly so that the right action can be taken. One of the first steps is to obtain a blood sample and to count how many of the different blood cells are present in it. This is called a complete blood count, and the information it provides has turned out to be surprisingly useful. A large number of certain white blood cells, for example, can show that the body is fighting an infection. But there might be several reasons why the number of white blood cells has increased, so this information alone is often not enough for a specific diagnosis. There are many hundreds of possible tests that can supplement the results of a complete blood count. These might identify bacteria or measure the concentrations of certain molecules in the blood, for example. But which test will give the important clue that reveals the source of the illness? This can be difficult to predict. Although each test helps to narrow down the final diagnosis they become increasingly expensive and time-consuming to perform, and rapid action is often important when treating a disease. Can we get more decisive information from the initial blood test by measuring other properties of the blood cells? Toepfner et al. now show that this is possible using a technique called real-time deformability cytometry. This method forces the blood cells in a small drop of blood to flow extremely rapidly through a narrow microfluidic channel while they are imaged by a fast camera. A computer algorithm can then analyze the size and stiffness of the blood cells in real-time. Toepfner et al. show that this approach can detect characteristic changes that affect blood cells as a result of malaria, spherocytosis, bacterial and viral infections, and leukemia. Furthermore, many thousands of blood cells can be measured in a few minutes — fast enough to be suitable as a diagnostic test. These proof-of-concept findings can now be used to develop actual diagnostic tests for a wide range of blood-related diseases. The approach could also be used to test which of several drugs is working to treat a certain medical condition, and to monitor whether the treatment is progressing as planned.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,032
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,315
Score d'incertitude au seuil0,978

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,032
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0100,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,3150,152

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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