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Enregistrement W4250006491 · doi:10.5858/2008-132-1635-coqiwc

Comparison of Quantitative Immunofluorescence With Conventional Methods for HER2/neu Testing With Respect to Response to Trastuzumab Therapy in Metastatic Breast Cancer

2008· article· en· W4250006491 sur OpenAlexaff
Jennifer M. Giltnane, Annette M. Molinaro, Huan Cheng, Andrew Robinson, Dmitry Turbin, Karen A. Gelmon, David G. Huntsman, David L. Rimm

Notice bibliographique

RevueArchives of Pathology & Laboratory Medicine · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensVancouver General HospitalUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer Institute
Mots-clésImmunohistochemistryTissue microarrayTrastuzumabBreast cancerMedicineInternal medicineCancerFish <Actinopterygii>Context (archaeology)OncologyPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Context. —Selection for trastuzumab therapy depends on a companion diagnostic assessment of HER2 by either immunohistochemistry (IHC) for protein overexpression or fluorescence in situ hybridization (FISH) to detect gene amplification. Although many studies have compared IHC to FISH, few have compared the tests to the true gold standard, tumor response. Objective. —To compare HER2 testing by FISH and IHC along with a third immunofluorescence-based assay (automated quantitative analysis–tissue microarray [AQUA-TMA]) and to assess the value of each test for prediction of response to trastuzumab. Design. —Immunohistochemistry and FISH assays were done on both whole slides (IHC-WS and FISH-WS) and on TMAs (IHC-TMA and FISH-TMA). AQUA was only done on TMAs (AQUA-TMA). Response was assessed according to modified Response Evaluation Criteria in Solid Tumors. Results. —AQUA-TMA scores showed a significant linear relationship to both the FISH signal ratio and IHC scores on whole sections and TMAs. Assay assessment by outcome showed no association between response and FISH-WS ratio ( P = .96), FISH-TMA ( P = .55), IHC-WS ( P = .75), or IHC-TMA ( P = .06), but a significant relationship between AQUA score and categoric response was observed ( P = .01). Assessed as a function of outcome using models of logistic regression, both AQUA-TMA and IHC-TMA were equally significant ( P = .01). FISH-WS was the most sensitive assay, with a significantly higher true-positive fraction than all other tests except AQUA-TMA, although it was the least specific. IHC-TMA was the most specific assay. The lowest misclassification rate was achieved using AQUA-TMA (0.30). Conclusions. —Both AQUA-TMA and IHC-TMA were substantially more predictive than the FISH or IHC-WS tests. Although these results are derived from a small retrospective series, they suggest that accurate measurement of protein expression and unbiased selection of tissue for measurement may be key factors in prediction of response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,700
Score d'incertitude au seuil0,768

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,131
Tête enseignante GPT0,490
Écart entre enseignants0,358 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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