Structural Modifications of <i>Methanococcus Jannaschii</i> Flagellin Proteins Revealed by Proteome Analysis
Notice bibliographique
Résumé
Methanococcus jannaschii is an autotrophic archaeon originally isolated from an oceanic thermal vent. The primary metabolic pathway for energy production in this hyperthermophilic microbe is methanogenesis from H 2 and CO 2 . As an autotroph, M. jannaschii requires only CO 2 as a carbon source for synthesizing all necessary biomolecules. Changes in the environmental availability of these molecules can be expected to activate regulatory mechanisms manifested as the up and down regulation of specific genes and the concomitant increase and decrease in abundance of the corresponding proteins. In our analysis of the proteome of M. jannaschii, we have observed significant changes in the abundance of a common subset of predominant proteins in response to reduced H 2 concentration, limited ammonium availability and the stage of cell growth (exponential compared with stationary). The masses of tryptic peptides from these proteins match those predicted by M. jannaschii genome open reading frames annotated as flagellin B1 (MJ0891) and flagellin B2 (MJ0892). Multiple proteins with different isoelectric points and molecular weights match each of these proteins and the abundance of these protein variants changes with growth conditions. These data indicate that structural modifications altering both the isoelectric point and size of the M. jannaschii flagellin B1 and B2 proteins occur in response to growth conditions and growth stage of M. jannaschii and further suggest the regulation of M. jannaschii motility through structural modifications of the building blocks of the flagella.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».