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Enregistrement W4250094760 · doi:10.22215/etd/2014-10376

Identification of Novel Translation Related Genes in Saccharomyces Cerevisiae

2014· dissertation· en· W4250094760 sur OpenAlexaff
Tan Le

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneTranslation (biology)GeneticsSaccharomyces cerevisiaeBiologyPlasmidEukaryotic translationEIF4EBP1Computational biologyMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Translation in eukaryotic organisms is a vital process in the gene expression pathway.This process requires control and precision to generate functional proteins that mediate cell activities.Previously, a large scale screening approach identied 80 novel Saccharomyces cerevisiae's genes that appeared to aect translation delity.In this current research, four candidate genes were selected for further investigation: YGR117C, YNL122C, YJR014W and YNL040W.The deletions of these genes were investigated for their eects on translation delity using plasmids, pUKC817, pUKC818 and pUKC819, containing premature stop codons, UAA, UGA and UAG, respectively, in LacZ cassette.A GAL1 inducible plasmid was used to test translation eciency of these deletion strains.YNL040W and YJR014W were screened for genetic interactions with other translation genes.Altogether, our ndings provide evidence for the involvement of the target genes in translation.It also supports the idea that there exist other novel translation genes that need to be investigated.whose support, guidance and contributions have helped me considerably throughout the research.I would also like to extend my thanks to my thesis committee member Dr. Myron Smith who have given insightful ideas for improvements of the research.Thanks to Bahram Samanfar for training and continuous technical support and encouragements in the lab.Thanks to Dr. Firoozeh Chalabian for

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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Résumé présentoui

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