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Enregistrement W4250126090 · doi:10.3410/f.737633112.793573927

Faculty Opinions recommendation of Fungal kinases and transcription factors regulating brain infection in Cryptococcus neoformans.

2020· dataset· en· W4250126090 sur OpenAlexaff
Leah E. Cowen, Elizabeth J. Polvi

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2020
Typedataset
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMinistry of Science and ICT, South KoreaKorea Health Industry Development InstituteMinistry of Agriculture, Food and Rural AffairsNational Research Foundation
Mots-clésCryptococcus neoformansBiologyInfectivityTranscription factorKinaseCryptococcosisMicrobiologyCell biologyImmunologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cryptococcus neoformans causes fatal fungal meningoencephalitis.Here, we study the roles played by fungal kinases and transcription factors (TFs) in blood-brain barrier (BBB) crossing and brain infection in mice.We use a brain infectivity assay to screen signature-tagged mutagenesis (STM)-based libraries of mutants defective in kinases and TFs, generated in the C. neoformans H99 strain.We also monitor in vivo transcription profiles of kinases and TFs during host infection using NanoString technology.These analyses identify signalling components involved in BBB adhesion and crossing, or survival in the brain parenchyma.The TFs Pdr802, Hob1, and Sre1 are required for infection under all the conditions tested here.Hob1 controls the expression of several factors involved in brain infection, including inositol transporters, a metalloprotease, PDR802, and SRE1.However, Hob1 is dispensable for most cellular functions in Cryptococcus deuterogattii R265, a strain that does not target the brain during infection.Our results indicate that Hob1 is a master regulator of brain infectivity in C. neoformans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Évaluation · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,999
Score d'incertitude au seuil0,226

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0070,011
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0680,038

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineÉvaluation
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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