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Enregistrement W4250540554 · doi:10.5376/mpb.2019.10.0007

Construction of Fingerprint of <i>Michelia</i> Germplasm by Fluorescent SSR Markers

2019· article· en· W4250540554 sur OpenAlexvenueno aff
Xudong He, Zhongyi Jiao, Jiwei Zheng, Dou QuanQin, Libin Huang, Baosong Wang, Ruifang Huang

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGermplasmBiologyLoss of heterozygosityGenotypingMicrosatelliteAlleleLocus (genetics)GeneticsGenotypeBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study, a fingerprinting system for 16 Michelia germplasms was established using high-throughput genotyping of fluorescent simple sequence repeat (SSR) markers. In total, 102 alleles were detected using 13 pairs of SSR markers from closely related species, and the number of alleles per locus ranged from 5 to 11, with an average of 7.8 alleles. Observed heterozygosity (Ho), expected heterozygosity (He), and polymorphic information content (PIC) ranged from 0.1250 to 0.5625 (mean 0.3650), 0.6703 to 0.9113 (mean 0.8099), and 0.5748 to 0.8714 (mean 0.7515), respectively. Among the four selected core primer pairs, the combinations LT106 and SGA5, LT106 and LT58, and SGA5 and MMA51 could unambiguously distinguish 16 Michelia germplasms. A cluster analysis showed the similarity coefficient of the 16 Michelia germplasms to range from 0.70 to 0.90, and different individuals from the same species clustered in the same branch. The fluorescence SSR genotyping system established in this study was efficient, rapid, and accurate; moreover, this approach provides a theoretical basis for identifying germplasms and for the protection of new varieties of the genus Michelia , and it provides a robust foundation for further breeding development of Michelia sp.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,175
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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Résumé présentoui

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