MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4251017296 · doi:10.1080/07060660809507503

Physiologic specialization of<i>Puccinia triticina</i>in Canada in 2005<sub>1</sub>

2008· article· en· W4251017296 sur OpenAlexaffvenueabout
Brent McCallum, P. Seto-Goh

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirulenceBiologyPhenotypePathogenGeneWheat leaf rustRust (programming language)MicrobiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Collections of Puccinia triticina, the causal agent of wheat (Triticum aestivum) leaf rust, were sampled across Canada in 2005 to determine the virulence spectrum of this pathogen and detect changes in virulence to important resistance genes. Forty virulence phenotypes were identified from 420 P. triticina isolates. Four virulence phenotypes, MBBJ, NBBR, TDBG, and TLGJ, were identified from five isolates collected in Quebec and six virulence phenotypes, MBJD, MCDS, MCPS, MFDS, MFPS, and TCTF, from six isolates from Ontario. Thirty-five virulence phenotypes were identified from the 396 isolates collected in the eastern prairie region (Manitoba and eastern Saskatchewan) of Canada, with TDBG (46.7%), TBBG (10.9%), and TDBJ (9.1%) being the most common phenotypes. Virulence phenotypes TDBG and TBBG and other similar phenotypes found in high frequency in 2005 had some unusual virulence characteristics, including avirulence to LrCen, Lr14a, and Lr20, which had previously been rare in Canada. Four virulence phenotypes, MBBJ, MBDS, MBGJ, and MBPS, were identified among 13 isolates from Alberta or British Columbia. Of 81 representative isolates, 74, 77, 4, and 67 isolates were virulent to wheat lines with the adult plant resistance genes Lr12, Lr13, Lr35, and Lr37, respectively. None of these were virulent to Lr22a. When tested on an extended set of wheat leaf rust differentials, 46, 43, 74, 60, 51, and 39 of the 81 isolates were virulent to the seedling resistance genes Lr3bg, Lr14b, Lr15, Lr20, Lr23, and Lr28, respectively, yet no virulence was detected to Lr19, Lr21, Lr25, Lr29, or Lr32

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,129

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,166
Écart entre enseignants0,151 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2008
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of Plant PathologyMême sujetWheat and Barley Genetics and PathologyTravaux en français237 207