Clues to finding correlates of risk/protection for HIV-1 vaccines
Notice bibliographique
Résumé
Almost a decade later, we still do not understand why in the STEP trial (2008), males with pre-existing antibodies to the Ad5 vector were associated with initial increased risk of HIV-1 acquisition. Similarly, we have little conclusive evidence of why in the RV144 trial (2009), vaccination with the ALVAC-HIV/AIDSVAX B/E was associated initially with almost a 60% vaccine efficacy at year one, which waned over 42 months to 31.2%, and where females were more protected than males. Based on the literature and trial outcomes, it was deduced that the elusive correlate of risk/protection may pertain to a novel, potent, innate protector mechanism launched by alternatively activated macrophages, which is probably induced by viruses and female steroid hormones. It was also suggested this mechanism was not likely amenable to discovery using standard or traditional approaches. A plausible, candidate mechanism was identified with these characteristics, namely the production of human endogenous retrovirus–K102 (HERV-K102) particles, which occurs in, and generates, foamy macrophages in vitro . Accumulating clinical, biological and phylogenetic evidence supports its role in the antagonism of HIV-1 replication and/or in the prevention of HIV-1 acquisition. Thus, it will be important to examine HERV-K102 particle production, increased integration and envelop antibody production as candidate correlates of protection in HIV-1 vaccine trials, as well as in HIV-1 highly exposed seronegative cohorts and elite controllers. The results of such efforts may have important ramifications for the HIV-1 cure in addition to vaccines.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,022 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».