MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4251180468 · doi:10.12688/f1000research.11818.1

Clues to finding correlates of risk/protection for HIV-1 vaccines

2017· preprint· en· W4251180468 sur OpenAlexaff
Marian P. Laderoute

Notice bibliographique

RevueF1000Research · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensCommunications Research Centre Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVaccinationVaccine trialImmunologyHIV vaccineMechanism (biology)VirologyClinical trialMedicineBiologyHuman immunodeficiency virus (HIV)AntibodyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Almost a decade later, we still do not understand why in the STEP trial (2008), males with pre-existing antibodies to the Ad5 vector were associated with initial increased risk of HIV-1 acquisition. Similarly, we have little conclusive evidence of why in the RV144 trial (2009), vaccination with the ALVAC-HIV/AIDSVAX B/E was associated initially with almost a 60% vaccine efficacy at year one, which waned over 42 months to 31.2%, and where females were more protected than males. Based on the literature and trial outcomes, it was deduced that the elusive correlate of risk/protection may pertain to a novel, potent, innate protector mechanism launched by alternatively activated macrophages, which is probably induced by viruses and female steroid hormones. It was also suggested this mechanism was not likely amenable to discovery using standard or traditional approaches. A plausible, candidate mechanism was identified with these characteristics, namely the production of human endogenous retrovirus–K102 (HERV-K102) particles, which occurs in, and generates, foamy macrophages in vitro . Accumulating clinical, biological and phylogenetic evidence supports its role in the antagonism of HIV-1 replication and/or in the prevention of HIV-1 acquisition. Thus, it will be important to examine HERV-K102 particle production, increased integration and envelop antibody production as candidate correlates of protection in HIV-1 vaccine trials, as well as in HIV-1 highly exposed seronegative cohorts and elite controllers. The results of such efforts may have important ramifications for the HIV-1 cure in addition to vaccines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,022
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,022
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueF1000ResearchMême sujetHIV Research and TreatmentTravaux en français237 207