Peer Review #2 of "Shared mycorrhizae but distinct communities of other root-associated microbes on co-occurring native and invasive maples (v0.1)"
Notice bibliographique
Résumé
Background.Biological invasions are major drivers of environmental change that can significantly alter ecosystem function and diversity.In plants, soil microbes play an important role in plant establishment and growth, however relatively little is known about the role they might play in biological invasions.A first step to assess whether root microbes may be playing a role in the invasion process is to find out if invasive plants host different microbes than neighbouring native plant species. Methods.In this study we investigated differences in root associated microbes of native sugar maple (Acer saccharum Marsh.) and exotic Norway maple (A.platanoides L.) collected from a forested reserve in eastern Canada.We used microscopy to examine root fungi and high-throughput sequencing to characterize the bacterial, fungal and arbuscular mycorrhizal communities of both maple species over one growing season.Results.We found differences in root associated bacterial and fungal communities between host species.Norway maple had a higher bacterial and fungal OTU (operational taxonomic units) richness compared to sugar maple, and the indicator species analysis revealed that nine fungal OTUs and three bacterial OTUs had a significant preference for sugar maple.The dominant bacterial phyla found on the roots of both maple species were Actinobacteria and Proteobacteria.The most common fungal orders associated with the Norway maple roots (in descending order) were Helotiales, Agaricales, Pleosporales, Hypocreales, Trechisporales while the Agaricales, Pleosporales, Helotiales, Capnodiales and Hypocreales were the dominant orders present in the Sugar maple roots.Dark septate fungi colonization levels were higher in the sugar maple, but no differences in arbuscular mycorrhizal fungal communities and colonization rates were detected between maple species.Discussion: Our findings show that two congeneric plant species grown in close proximity can harbor distinct root microbial communities.These findings provide further support for the importance of plant species in structuring root associated microbe communities.The high colonization levels observed in Norway maple demonstrates its compatibility with arbuscular mycorrhizal fungi in the introduced range.Plant-associated microbial communities can affect host fitness and function in many ways; therefore, the observed differences suggest a possibility that biotic interactions can influence the dynamics between native and invasive species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,012 | 0,088 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,002 |
| Communication savante | 0,006 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,183 | 0,086 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».